RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	IZH4	Q99393	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	STE7	P06784	515 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	INO4	P13902	151 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ANB1	P19211	157 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MRP17	P28778	131 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MOT1	P32333	1867 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	UTR5	P32630	166 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	TKL2	P33315	681 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SWM2	P40342	146 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	AVT7	P40501	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	FRE4	P53746	719 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ABF2	Q02486	183 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	PIN3	Q06449	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	NUS1	Q12063	375 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	HUT1	Q12520	339 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RIM15	P43565	1770 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	FLO1	P32768	1537 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	CHO1	P08456	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	GPI12	P23797	304 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MSS51	P32335	436 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	FRM2	P37261	193 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
RIM4	YHL024W	SUR7	P54003	302 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ANT1	Q06497	328 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	CRC1	Q12289	327 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	TIM9	O74700	87 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YHL026C	P38740	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YIL012W	P40551	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YGR015C	P53208	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YNR048W	P53740	393 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SPR6	Q01684	191 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	THI74	Q04083	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	LIP2	Q06005	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	PAU23	Q07987	124 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	PAU17	Q12370	124 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	FCY2	P17064	533 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SCO1	P23833	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SYN8	P31377	255 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SFC1	P33303	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SDH3	P33421	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	DRE2	P36152	348 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YHR177W	P38867	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SCS3	P53012	380 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ALG13	P53178	202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	APJ1	P53940	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	VBA1	Q04301	562 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YMR320W	Q04897	101 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MCT1	Q12283	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	POX1	P13711	748 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	OAC1	P32332	324 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	COX13	P32799	129 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	POP8	P38208	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SLM6	P38343	150 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	AYR1	P40471	297 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YFL065C	P43539	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	CIN2	P46670	268 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	CTK2	P46962	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	SOR2	Q07786	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RIM4	YHL024W	MCH4	Q08268	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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