RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeastyeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDS3YGL197W RPL25P04456 142 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COS2P0CX12 379 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COS3P0CX13 379 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GAL3P13045 520 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YSR3P23501 404 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DER1P38307 211 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YBR220CP38318 560 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPF1P38805 295 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W IKI1P38874 309 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RRT8Q08219 342 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YOL107WQ12239 342 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GPM3Q12326 303 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W WIP1Q2V2P8 89 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W THP2O13539 261 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PTM1P32857 523 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MRPS5P33759 307 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PRY2P36110 329 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ASC1P38011 319 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AVT2P39981 480 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GLR1P41921 483 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AGP3P43548 558 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W TOS2P50078 622 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ATP19P81451 68 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YDR366CP87287 132 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W TDA1Q03533 586 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YOL019WQ08157 551 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W APC9Q12107 265 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COX2P00410 251 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W STE3P06783 470 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W URA6P15700 204 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PHO85P17157 305 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SGE1P33335 543 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PRM9P39551 298 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HEM14P40012 539 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W LSM4P40070 187 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YER189WP40104 122 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W COA1P40452 197 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data1.05□□□□□ -2.24 RIP-Chip
MDS3YGL197W AGE2P40529 298 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CIN2P46670 268 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SPG1P50088 95 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AIF1P52923 378 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YGL159WP53110 370 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ALG9P53868 555 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W TRM82Q03774 444 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RUB1Q03919 77 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YNG1Q08465 219 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AGC1Q12482 902 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YLR412C-AQ3E742 68 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W KTI11Q3E840 82 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SAL1D6W196 494 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W IPP1P00817 287 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YGL041W-AP0C5N3 154 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GCN3P14741 305 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W IMP1P28627 190 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W LHP1P33399 275 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FRM2P37261 193 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AME1P38313 324 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W GOS1P38736 223 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YAR068WP39564 161 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W AST2P39945 430 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SMB1P40018 196 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W NUP57P48837 541 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MGA1P53050 456 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W PRM8P53174 237 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YLR460CP54007 376 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MED11Q99278 115 aa1.05□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HTB1P02293 131 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W HTB2P02294 131 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CDC33P07260 213 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W BDH1P39714 382 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FCY21P40039 528 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W OSW5P40219 148 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W FIS1P40515 155 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YPR127WQ06494 345 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SPC3Q12133 184 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W RTR2Q12378 196 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W Q0144Q9ZZW2 109 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W YHR139C-AO13536 103 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SPS2P08459 502 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W CKI1P20485 582 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W SEC22P22214 214 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W ELO2P25358 347 aa1.04□□□□□ -2.24
MDS3YGL197W MIG1P27705 504 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.4 ms