RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528920.5

TSTA3-208, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 964 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 MSLNLQ96KJ4 702 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 FNBP1Q96RU3 617 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CGRRF1Q99675 332 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CD320Q9NPF0 282 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 MTRRQ9UBK8 725 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TSC2P49815 1807 aa15.8■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 MAPK13O15264 365 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 C1RP00736 705 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TNNC2P02585 160 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ITGB3P05106 788 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 EPCAMP16422 314 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TAF6P49848 677 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CLCN4P51793 760 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 STIM1Q13586 685 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CEP135Q66GS9 1140 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 DSTYKQ6XUX3 929 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 APPL2Q8NEU8 664 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 SIX4Q9UIU6 781 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.79■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PSMA7O14818 248 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 AKAP3O75969 853 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TNNI1P19237 187 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PNPLA4P41247 253 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CLDN10P78369 228 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 RBP5P82980 135 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ADAM9Q13443 819 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD54Q6NXT1 300 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TMC2Q8TDI7 906 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 BORCS6Q96GS4 357 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 SENP8Q96LD8 212 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF560Q96MR9 790 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TSG101Q99816 390 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CD207Q9UJ71 328 aa15.78■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 H7C4K7 107 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ADAM12O43184 909 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TBC1D4O60343 1298 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GPR37L1O60883 481 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GLUD1P00367 558 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TYMPP19971 482 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 CCNE1P24864 410 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 LRRC63Q05C16 580 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 SV2CQ496J9 727 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 LILRA6Q6PI73 481 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 PALB2Q86YC2 1186 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 GPT2Q8TD30 523 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 ZNF516Q92618 1163 aa15.77■□□□□ 0.12
TSTA3-208ENST00000528920 KPNA7A9QM74 516 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 PI4K2BG5E9Z4 385 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 CETN3O15182 167 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 TGM5O43548 720 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 OAZ2O95190 189 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 CYP11A1P05108 521 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 KRT19P08727 400 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 ODC1P11926 461 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 OR1D2P34982 312 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 AP3M2P53677 418 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 RAB33AQ14088 237 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 CLUL1Q15846 466 aa15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSTA3-208ENST00000528920 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms