RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX33O43247 280 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCF3P15923 654 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP3CBP16298 524 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DYRK1AQ13627 763 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEMA3AQ14563 771 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFKQ969G6 155 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ORAI2Q96SN7 254 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYOCQ99972 504 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LANCL2Q9NS86 450 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNTG2Q9NY99 539 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDHR4A6H8M9 788 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 E5RJQ4 531 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDSP20132 328 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCP2P22307 547 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXPE1Q8N323 547 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STON2Q8WXE9 905 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALG8Q9BVK2 526 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KDM1AO60341 852 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BCAR3O75815 825 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJB5O75953 348 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGBP02675 491 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LPLP06858 475 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NR2F6P10588 404 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FPR1P21462 350 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGAP25P42331 645 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 Q4G0T1 1027 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRG5Q8IZF4 528 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D15Q8TC07 691 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRMOQ9BU70 441 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ICKQ9UPZ9 632 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF213O14771 459 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EBLN1P0CF75 366 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HTR6P50406 440 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PER3P56645 1201 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNGA4Q8IV77 575 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C8orf58Q8NAV2 365 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNX19Q92543 992 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D5Q92609 795 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COQ8BQ96D53 544 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM140Q9NV12 185 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCOCQ9UIL1 159 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTC3P53804 2025 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD8B2A6NJW9 211 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMIM22K7EJ46 135 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUN1O94901 812 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCSK1P29120 753 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCSK6P29122 969 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C16orf52Q8NHV5 167 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TLR10Q9BXR5 811 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EHD3Q9NZN3 535 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GAS8-AS1O95177 125 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OCRLQ01968 901 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms