RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516666.1

RNU6-1332P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1332, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1332P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SRGNP10124 158 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PDCP20941 246 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MALP21145 153 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SMARCA1P28370 1054 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MPLP40238 635 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NEK2P51955 445 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GNAI1P63096 354 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FOXI1Q12951 378 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PRR16Q569H4 304 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q6ZNX1 250 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 USP45Q70EL2 814 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPR150Q8NGU9 434 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CAGE1Q8TC20 777 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KAT5Q92993 513 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SCAMP4Q969E2 229 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPATCH3Q96I76 525 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 Q96MF0 132 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SIK2Q9H0K1 926 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 WDCPQ9H6R7 721 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CASS4Q9NQ75 786 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 E2F8A0AVK6 867 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC151A5D8V7 595 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 F2RL2O00254 374 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SOAT2O75908 522 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NUDT3O95989 172 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 POU2F2P09086 479 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SBK3P0C264 359 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CXCR5P32302 372 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IL12RB1P42701 662 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SNAPC2Q13487 334 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DYRK1AQ13627 763 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GEN1Q17RS7 908 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NELL1Q92832 810 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RAB24Q969Q5 203 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RIOX1Q9H6W3 641 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 BRD9Q9H8M2 597 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 KMT5AQ9NQR1 393 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 INTS13Q9NVM9 706 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 INSL6Q9Y581 213 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PROM1O43490 865 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ORC4O43929 436 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 PEX1O43933 1283 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IL33O95760 270 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FOLR3P41439 243 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HK3P52790 923 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 IGBP1P78318 339 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FPGSQ05932 587 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 NOGQ13253 232 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CCDC93Q567U6 631 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VWA1Q6PCB0 445 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MICALCLQ6ZW33 695 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZNF575Q86XF7 245 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SSH3Q8TE77 659 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RGMAQ96B86 450 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CAMKK2Q96RR4 588 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SMOQ99835 787 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 TLR10Q9BXR5 811 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 GPR35Q9HC97 309 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 CDYLQ9Y232 598 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 MPPED1O15442 326 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 SUN1O94901 812 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 ZFPL1O95159 310 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-1332P-201ENST00000516666 RARBP10826 455 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms