RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 LIG4P49917 911 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 HUNKP57058 714 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 MOGSQ13724 837 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CCNG2Q16589 344 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CEP128Q6ZU80 1094 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PARP9Q8IXQ6 854 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SCLT1Q96NL6 688 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CYP26B1Q9NR63 512 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 HAUS2Q9NVX0 235 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.5■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 YY1P25490 414 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PIK3CAP42336 1068 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 KATNAL2Q8IYT4 538 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CDHR1Q96JP9 859 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 YY1AP1Q9H869 796 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SLC12A4Q9UP95 1085 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 NEU2Q9Y3R4 380 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PARP14Q460N5 1801 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CALCAP01258 141 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ADCY8P40145 1251 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SNCBQ16143 134 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CCDC38Q502W7 563 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SWSAP1Q6NVH7 229 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 RELL1Q8IUW5 271 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CCDC89Q8N998 374 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 DYDC1Q8WWB3 177 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 HERPUD2Q9BSE4 406 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SCINQ9Y6U3 715 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 RLFQ13129 1914 aa27.49■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 THAP12O43422 761 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 IFNAR2P48551 515 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PRKCEQ02156 737 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 LLGL1Q15334 1064 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CCDC91Q7Z6B0 441 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 MAGEC3Q8TD91 643 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 FOXP3Q9BZS1 431 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 LGALS13Q9UHV8 139 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 TMEM120BA0PK00 339 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 RALAP11233 206 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 TNNI1P19237 187 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ACO1P21399 889 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SNX3O60493 162 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ATP2C2O75185 946 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 OAS1P00973 400 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 STRN3Q13033 797 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 VSTM1Q6UX27 236 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ZNF365Q70YC5 407 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 EXD1Q8NHP7 514 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 NINJ2Q9NZG7 142 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 OAZ1P54368 228 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 NOMO3P69849 1222 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CUL2Q13617 745 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 XKR3Q5GH77 459 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 SPRYD7Q5W111 196 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 REPS2Q8NFH8 660 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 ADAM22Q9P0K1 906 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 STAM2O75886 525 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PIGRP01833 764 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 RDXP35241 583 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 GTF2A2P52657 109 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 KYNUQ16719 465 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 CCDC77Q9BR77 488 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 OSBPL8Q9BZF1 889 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 RIPK3Q9Y572 518 aa27.46■■□□□ 1.99
OPN3-204ENST00000469376 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 CETN2P41208 172 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 LMNB2Q03252 620 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 SLFN12LQ6IEE8 588 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.45■■□□□ 1.98
OPN3-204ENST00000469376 ABHD15Q6UXT9 468 aa27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms