RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOMO3P69849 1222 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB21Q9UL25 225 aa23.35■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNK3O14649 394 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THAP12O43422 761 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD58P19256 250 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SESTD1Q86VW0 696 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DPP3Q9NY33 737 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRRDQ9UH36 339 aa23.34■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WEE2P0C1S8 567 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLCN6P51797 869 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBP5P82980 135 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAA35Q5VZE5 725 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALKAL1Q6UXT8 129 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MON1BQ7L1V2 547 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYFIP2Q96F07 1278 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF12Q96FN5 646 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP85Q9BW27 656 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNTG2Q9NY99 539 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLIQ9UNA4 740 aa23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCNTO95613 3336 aa23.33■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSM8O95777 96 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P4HA1P13674 534 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXD10P28358 340 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNA2P51530 1060 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB6Q15916 424 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MS4A14Q96JA4 679 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTN3Q9P232 1028 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALG6Q9Y672 507 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM170AA1A519 330 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELNP15502 786 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APLP1P51693 650 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2orf54Q08AI8 447 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPAINQ86UA6 219 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPA5Q8WXQ8 436 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HPDLQ96IR7 371 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.32■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC151A5D8V7 595 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGCRP04035 888 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFHP08603 1231 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BRD3Q15059 726 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBXN11Q5T124 520 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR93Q6P2C0 686 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH3Q86UC2 560 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERINC5Q86VE9 423 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNKPQ96T60 521 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHD2Q9NZN4 543 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.31■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAEPP09466 180 aa23.3■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.3■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.3■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0QZ92 97 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RECQL4O94761 1208 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNRH1P01148 92 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASGR1P07306 291 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP2K2P36507 400 aa23.29■■□□□ 1.32
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC39CQ8N584 583 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms