RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 CTNNB1P35222 781 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 HSPA13P48723 471 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 BIKQ13323 160 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 12
NDUFS1-201ENST00000233190 C16orf59Q7L2K0 433 aa7.22□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 CD58P19256 250 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 RFX3P48380 749 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 NOTUMQ6P988 496 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 RNF135Q8IUD6 432 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 CHST13Q8NET6 341 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 AK8Q96MA6 479 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 GUCY1B2O75343 617 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 COX7A2P14406 83 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 COPS2P61201 443 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 SEPT2Q15019 361 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 GALNT7Q86SF2 657 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 SERAC1Q96JX3 654 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 PIK3R2O00459 728 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 MTFR1LQ9H019 292 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 SPASTQ9UBP0 616 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 ABCB11O95342 1321 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 ADAMTS12P58397 1594 aa7.21□□□□□ -1.25
NDUFS1-201ENST00000233190 SGSM2O43147 1006 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FGFR2P21802 821 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CMA1P23946 247 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 EFNA5P52803 228 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 LRRC39Q96DD0 335 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 SYNMO15061 1565 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CDH13P55290 713 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TAP1Q03518 808 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 AHSPQ9NZD4 102 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GPS1Q13098 491 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GRAPQ13588 217 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RRM1P23921 792 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GPC1P35052 558 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RPS6KA3P51812 740 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TPI1P60174 286 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM51Q9NW97 253 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 STK36Q9NRP7 1315 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ANKARQ7Z5J8 1434 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 A8MXQ7 604 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 KCNA2P16389 499 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NOS2P35228 1153 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PNPLA4P41247 253 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 APLP1P51693 650 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NEK5Q6P3R8 708 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CPA6Q8N4T0 437 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM161BQ96MY7 647 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PRODHO43272 600 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 VSNL1P62760 191 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 SUSD6Q92537 303 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM117AQ9C073 453 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 WHRNQ9P202 907 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 GAKO14976 1311 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 KIAA0556O60303 1618 aa7.21□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MYL4P12829 197 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MLH1P40692 756 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 STAT3P40763 770 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 COG1Q8WTW3 980 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 STRADBQ9C0K7 418 aa7.2□□□□□ -1.26
NDUFS1-201ENST00000233190 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms