RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 APBB1O00213 710 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJB2P25686 324 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 MARVELD3Q96A59 401 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 POM121Q96HA1 1249 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.35□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 QPCTQ16769 361 aa4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 ERBB3P21860 1342 aa4.34□□□□□ -1.71
SPTAN1-232ENST00000636483 NBPF26B4DH59 902 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 ST18O60284 1047 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAK2O60296 914 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC10A3P09131 477 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RFC5P40937 340 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 HOMEZQ8IX15 550 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RDH13Q8NBN7 331 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 HLA-CQ95604 372 aa4.33□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEB3A0JP26 581 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM205CA6NFA0 338 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP33O14559 1287 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SPTLC1O15269 473 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 GUCA2AQ02747 115 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 MCM6Q14566 821 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 LHX8Q68G74 356 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 POTEBQ6S5H4 581 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 CABLES1Q8TDN4 633 aa4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 KDM4AO75164 1064 aa4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 GCGRP47871 477 aa4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 DIXDC1Q155Q3 683 aa4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SULF1Q8IWU6 871 aa4.31□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 A6NJR5 290 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 LILRB3O75022 631 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 AP1G2O75843 785 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.3□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 HRCP23327 699 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNH8Q96L42 1107 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 COG6Q9Y2V7 657 aa4.29□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 FDX1P10109 184 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 EMP3P54852 163 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 CTDSPL2Q05D32 466 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 BANK1Q8NDB2 785 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.28□□□□□ -1.72
SPTAN1-232ENST00000636483 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 HOXA2O43364 376 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 RAD21O60216 631 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF40O75150 1001 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 FUT2Q10981 343 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 MTMR14Q8NCE2 650 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 TSC1Q92574 1164 aa4.27□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ABL2P42684 1182 aa4.25□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.25□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.25□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.25□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 POM121CA8CG34 1229 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 CFAP99D6REC4 459 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 C6orf229H3BNL8 230 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 CFHP08603 1231 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 USP17L8P0C7I0 530 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 GJA5P36382 358 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP6V1AP38606 617 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 USP46P62068 366 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 MTMR2Q13614 643 aa4.24□□□□□ -1.73
SPTAN1-232ENST00000636483 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms