RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 ALKQ9UM73 1620 aa30.16■■■□□ 2.42
LTBP4-232ENST00000610893 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
LTBP4-232ENST00000610893 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
LTBP4-232ENST00000610893 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.15■■■□□ 2.42
LTBP4-232ENST00000610893 ILDR2Q71H61 639 aa30.14■■■□□ 2.42
LTBP4-232ENST00000610893 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.14■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 E9PCH4 1651 aa30.13■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.11■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM94Q12767 1356 aa30.11■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 TBX22Q9Y458 520 aa30.09■■■□□ 2.41
LTBP4-232ENST00000610893 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
LTBP4-232ENST00000610893 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
LTBP4-232ENST00000610893 NAIPQ13075 1403 aa30.03■■■□□ 2.4
LTBP4-232ENST00000610893 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.01■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 NWD1Q149M9 1564 aa29.99■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.99■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 SOCS7O14512 581 aa29.99■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 PIK3R4Q99570 1358 aa29.96■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.96■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 MSH6P52701 1360 aa29.95■■■□□ 2.39
LTBP4-232ENST00000610893 HFM1A2PYH4 1435 aa29.95■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 TRIM52Q96A61 297 aa29.92■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.92■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 DIP2AQ14689 1571 aa29.9■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 SLAIN2Q9P270 581 aa29.89■■■□□ 2.38
LTBP4-232ENST00000610893 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.88■■■□□ 2.37
LTBP4-232ENST00000610893 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.85■■■□□ 2.37
LTBP4-232ENST00000610893 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
LTBP4-232ENST00000610893 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
LTBP4-232ENST00000610893 C14orf37Q86TY3 774 aa29.83■■■□□ 2.37
LTBP4-232ENST00000610893 TRPM2O94759 1503 aa29.82■■■□□ 2.36
LTBP4-232ENST00000610893 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.82■■■□□ 2.36
LTBP4-232ENST00000610893 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.79■■■□□ 2.36
LTBP4-232ENST00000610893 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.77■■■□□ 2.36
LTBP4-232ENST00000610893 CLTCL1P53675 1640 aa29.76■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 ATF3P18847 181 aa29.76■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 PTPRUQ92729 1446 aa29.76■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.76■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.72■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 METP08581 1390 aa29.71■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.71■■■□□ 2.35
LTBP4-232ENST00000610893 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.7■■■□□ 2.34
LTBP4-232ENST00000610893 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
LTBP4-232ENST00000610893 KIF1BO60333 1816 aa29.67■■■□□ 2.34
LTBP4-232ENST00000610893 DCCP43146 1447 aa29.64■■■□□ 2.34
LTBP4-232ENST00000610893 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.64■■■□□ 2.34
LTBP4-232ENST00000610893 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
LTBP4-232ENST00000610893 FOXD1Q16676 465 aa29.63■■■□□ 2.33
LTBP4-232ENST00000610893 JCADQ9P266 1359 aa29.62■■■□□ 2.33
LTBP4-232ENST00000610893 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
LTBP4-232ENST00000610893 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.57■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 BRINP3Q76B58 766 aa29.57■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 PHLPP1O60346 1717 aa29.57■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.53■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.53■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.51■■■□□ 2.32
LTBP4-232ENST00000610893 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 RGL3Q3MIN7 710 aa29.5■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 MST1RQ04912 1400 aa29.5■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 PTCH1Q13635 1447 aa29.5■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.48■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.47■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.46■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.45■■■□□ 2.31
LTBP4-232ENST00000610893 PPLO60437 1756 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBP4-232ENST00000610893 POTEAQ6S8J7 498 aa29.44■■■□□ 2.3
LTBP4-232ENST00000610893 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.42■■■□□ 2.3
LTBP4-232ENST00000610893 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
LTBP4-232ENST00000610893 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
LTBP4-232ENST00000610893 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.38■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.37■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.36■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 LRP6O75581 1613 aa29.33■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 SHPRHQ149N8 1683 aa29.33■■■□□ 2.29
LTBP4-232ENST00000610893 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC11Q96J66 1382 aa29.32■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 STK26Q9P289 416 aa29.32■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 PIK3C2GO75747 1445 aa29.31■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 HRCP23327 699 aa29.31■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 ORAI2Q96SN7 254 aa29.31■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 TECPR2O15040 1411 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.3■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.29■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms