RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568146.1

NOL3-211, Transcript of nucleolar protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOL3, Length 1,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3-211ENST00000568146 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.2■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 KCNA6P17658 529 aa28.18■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.18■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 NAIPQ13075 1403 aa28.17■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 NWD1Q149M9 1564 aa28.15■■■□□ 2.1
NOL3-211ENST00000568146 ILDR2Q71H61 639 aa28.13■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 TMEM94Q12767 1356 aa28.13■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 BCANQ96GW7 911 aa28.09■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 HFM1A2PYH4 1435 aa28.08■■■□□ 2.09
NOL3-211ENST00000568146 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.07■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.07■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 TBX22Q9Y458 520 aa28.05■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
NOL3-211ENST00000568146 DIP2AQ14689 1571 aa28■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 TRPM2O94759 1503 aa27.99■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.98■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 CLTCL1P53675 1640 aa27.97■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 PIK3R4Q99570 1358 aa27.95■■■□□ 2.07
NOL3-211ENST00000568146 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.93■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 MSH6P52701 1360 aa27.92■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.92■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 TRIM52Q96A61 297 aa27.91■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 PTPRUQ92729 1446 aa27.91■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.9■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.89■■■□□ 2.06
NOL3-211ENST00000568146 SOCS7O14512 581 aa27.88■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.88■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.85■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 SLAIN2Q9P270 581 aa27.84■■■□□ 2.05
NOL3-211ENST00000568146 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NOL3-211ENST00000568146 KIF1BO60333 1816 aa27.82■■■□□ 2.04
NOL3-211ENST00000568146 METP08581 1390 aa27.82■■■□□ 2.04
NOL3-211ENST00000568146 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.78■■■□□ 2.04
NOL3-211ENST00000568146 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
NOL3-211ENST00000568146 C14orf37Q86TY3 774 aa27.76■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 FOXD1Q16676 465 aa27.75■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.73■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.71■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.71■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 DCCP43146 1447 aa27.7■■■□□ 2.03
NOL3-211ENST00000568146 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 ATF3P18847 181 aa27.7■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 PHLPP1O60346 1717 aa27.69■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 PPLO60437 1756 aa27.67■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.65■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.64■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
NOL3-211ENST00000568146 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.64■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.63■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.63■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 JCADQ9P266 1359 aa27.63■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 MST1RQ04912 1400 aa27.62■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 PTCH1Q13635 1447 aa27.62■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 BRINP3Q76B58 766 aa27.61■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.59■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.59■■■□□ 2.01
NOL3-211ENST00000568146 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.57■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.57■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.55■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 RGL3Q3MIN7 710 aa27.54■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 IFT172Q9UG01 1749 aa27.54■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.53■■■□□ 2
NOL3-211ENST00000568146 LRP6O75581 1613 aa27.5■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.49■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 SHPRHQ149N8 1683 aa27.49■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 POTEAQ6S8J7 498 aa27.48■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.48■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 PIK3C2GO75747 1445 aa27.48■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.48■■□□□ 1.99
NOL3-211ENST00000568146 TECPR2O15040 1411 aa27.45■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.4■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 ABCC11Q96J66 1382 aa27.39■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 LAMC1P11047 1609 aa27.39■■□□□ 1.98
NOL3-211ENST00000568146 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.38■■□□□ 1.97
NOL3-211ENST00000568146 MYOM2P54296 1465 aa27.38■■□□□ 1.97
NOL3-211ENST00000568146 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.38■■□□□ 1.97
NOL3-211ENST00000568146 ORAI2Q96SN7 254 aa27.37■■□□□ 1.97
NOL3-211ENST00000568146 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
NOL3-211ENST00000568146 STK26Q9P289 416 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms