RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 E9PCH4 1651 aa36.9■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.9■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.5
ACER3-211ENST00000531461 TMEM94Q12767 1356 aa36.88■■■■□ 3.49
ACER3-211ENST00000531461 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.86■■■■□ 3.49
ACER3-211ENST00000531461 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.84■■■■□ 3.49
ACER3-211ENST00000531461 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.84■■■■□ 3.49
ACER3-211ENST00000531461 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
ACER3-211ENST00000531461 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ACER3-211ENST00000531461 NUP155O75694 1391 aa36.77■■■■□ 3.48
ACER3-211ENST00000531461 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.48
ACER3-211ENST00000531461 BCANQ96GW7 911 aa36.76■■■■□ 3.48
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
ACER3-211ENST00000531461 TBX22Q9Y458 520 aa36.73■■■■□ 3.47
ACER3-211ENST00000531461 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
ACER3-211ENST00000531461 ITGAEP38570 1179 aa36.7■■■■□ 3.47
ACER3-211ENST00000531461 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 DIP2AQ14689 1571 aa36.69■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 MSH6P52701 1360 aa36.67■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.66■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.66■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 PIK3R4Q99570 1358 aa36.64■■■■□ 3.46
ACER3-211ENST00000531461 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.62■■■■□ 3.45
ACER3-211ENST00000531461 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
ACER3-211ENST00000531461 SLAIN2Q9P270 581 aa36.56■■■■□ 3.44
ACER3-211ENST00000531461 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
ACER3-211ENST00000531461 TRPM2O94759 1503 aa36.54■■■■□ 3.44
ACER3-211ENST00000531461 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 NAIPQ13075 1403 aa36.48■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.48■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.47■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 PHLPP1O60346 1717 aa36.47■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
ACER3-211ENST00000531461 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.44■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 PTPRUQ92729 1446 aa36.42■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.42■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.41■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 CLTCL1P53675 1640 aa36.41■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 C14orf37Q86TY3 774 aa36.39■■■■□ 3.42
ACER3-211ENST00000531461 JCADQ9P266 1359 aa36.38■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 KIF1BO60333 1816 aa36.36■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 HFM1A2PYH4 1435 aa36.36■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.35■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 ATF3P18847 181 aa36.35■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 DCCP43146 1447 aa36.34■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
ACER3-211ENST00000531461 METP08581 1390 aa36.28■■■■□ 3.4
ACER3-211ENST00000531461 POTEAQ6S8J7 498 aa36.23■■■■□ 3.39
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.22■■■■□ 3.39
ACER3-211ENST00000531461 SHPRHQ149N8 1683 aa36.21■■■■□ 3.39
ACER3-211ENST00000531461 TRIM52Q96A61 297 aa36.2■■■■□ 3.39
ACER3-211ENST00000531461 BRINP3Q76B58 766 aa36.19■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 MST1RQ04912 1400 aa36.17■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.15■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.14■■■■□ 3.38
ACER3-211ENST00000531461 LRP6O75581 1613 aa36.12■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.12■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.12■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 PTCH1Q13635 1447 aa36.1■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.1■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 PPLO60437 1756 aa36.1■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.08■■■■□ 3.37
ACER3-211ENST00000531461 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.99■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.96■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 LAMC1P11047 1609 aa35.96■■■■□ 3.35
ACER3-211ENST00000531461 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.94■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 FOXD1Q16676 465 aa35.92■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.91■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 IFT172Q9UG01 1749 aa35.89■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.89■■■■□ 3.34
ACER3-211ENST00000531461 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.87■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.86■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.83■■■■□ 3.33
ACER3-211ENST00000531461 TECPR2O15040 1411 aa35.82■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.81■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 RGL3Q3MIN7 710 aa35.78■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 ORAI2Q96SN7 254 aa35.78■■■■□ 3.32
ACER3-211ENST00000531461 AFF2P51816 1311 aa35.78■■■■□ 3.32
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