RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523787.5

CEP57L1-223, Transcript of centrosomal protein 57 like 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CEP57L1, Length 2,522 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP57L1-223	ENST00000523787	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		5	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		5	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	SULF1	Q8IWU6	871 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	RGS20	O76081	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	RDH13	Q8NBN7	331 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CEP57L1-223	ENST00000523787	TK2	O00142	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	CD46	P15529	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	RNF40	O75150	1001 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	STAC3	Q96MF2	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SLC10A3	P09131	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	HR	O43593	1189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	KDM4A	O75164	1064 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	GCGR	P47871	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CEP57L1-223	ENST00000523787	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	CFH	P08603	1231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NDUFV2	P19404	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	USP46	P62068	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	HOXA2	O43364	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	SPTLC1	O15269	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	FUT2	Q10981	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	WNT2B	Q93097	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	BCAM	P50895	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PPP4C	P60510	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	HLA-C	Q95604	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	FDX1	P10109	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	GJA5	P36382	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	QPCT	Q16769	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	RFC5	P40937	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	FLII	Q13045	1269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	LILRB3	O75022	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	HRC	P23327	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CEP57L1-223	ENST00000523787	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms