RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRR20AP86496 221 aa12.08□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EYA1Q99502 592 aa12.07□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.06□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.06□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.06□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.01□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM187AA6NFU0 413 aa12□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLL1O43897 1013 aa12□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KMT5BQ4FZB7 885 aa12□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POTECB2RU33 542 aa11.99□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DNAJB2P25686 324 aa11.99□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 S1PR4O95977 384 aa11.98□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.97□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNFRSF10AO00220 468 aa11.96□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GDF9O60383 454 aa11.95□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.94□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADH1BP00325 375 aa11.93□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TREML4Q6UXN2 200 aa11.93□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NR1I2O75469 434 aa11.92□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CFHP08603 1231 aa11.91□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AAASQ9NRG9 546 aa11.9□□□□□ -0.5
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ST8SIA5O15466 376 aa11.88□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.88□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTGDRQ13258 359 aa11.87□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.87□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RCCD1A6NED2 376 aa11.86□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CFAP44Q96MT7 982 aa11.85□□□□□ -0.51
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXC1Q12948 553 aa11.83□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.83□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.82□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.82□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC10A3P09131 477 aa11.81□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.81□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.81□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPSB2Q99619 263 aa11.79□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPIAP49247 311 aa11.78□□□□□ -0.52
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WFS1O76024 890 aa11.77□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NUTM2FA1L443 756 aa11.76□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AXIN1O15169 862 aa11.76□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AVPP01185 164 aa11.76□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM161AQ3B820 660 aa11.76□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.75□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP4X1Q8N118 509 aa11.75□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OATP04181 439 aa11.73□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.73□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STK17AQ9UEE5 414 aa11.72□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DACH1Q9UI36 760 aa11.72□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCHSD2O94868 740 aa11.71□□□□□ -0.53
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.69□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WIPF1O43516 503 aa11.65□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MORN1Q5T089 497 aa11.63□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNV2Q8TDN2 545 aa11.63□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RDH13Q8NBN7 331 aa11.62□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 THAP11Q96EK4 314 aa11.62□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP6V1AP38606 617 aa11.61□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FUT2Q10981 343 aa11.6□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HIC1Q14526 733 aa11.58□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SENP2Q9HC62 589 aa11.58□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.57□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.57□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WNT7AO00755 349 aa11.56□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.55□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMPD1P17405 629 aa11.54□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.54□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MSS51Q4VC12 460 aa11.53□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BRICD5Q6PL45 260 aa11.53□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SULF1Q8IWU6 871 aa11.53□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM47Q96LD4 638 aa11.53□□□□□ -0.56
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCGRP47871 477 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms