RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	SMAP	O00193	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	PSEN2	P49810	448 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	MCM6	Q14566	821 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	GJA5	P36382	358 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	SPTLC1	O15269	473 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	ST18	O60284	1047 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	EMP3	P54852	163 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115		A6NJR5	290 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	USP46	P62068	366 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	BANK1	Q8NDB2	785 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	RFC5	P40937	340 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.43	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	KDM4A	O75164	1064 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	GCGR	P47871	477 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ETV1-223	ENST00000497115	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	TK2	O00142	265 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	SLC10A3	P09131	477 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	SOCS7	O14512	581 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	HOXA2	O43364	376 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	LILRB3	O75022	631 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	NDUFV2	P19404	249 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	QPCT	Q16769	361 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ETV1-223	ENST00000497115	RAD21	O60216	631 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	TRAK2	O60296	914 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	FDX1	P10109	184 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	APBB1	O00213	710 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	CFH	P08603	1231 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	HRC	P23327	699 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ETV1-223	ENST00000497115	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	FUT2	Q10981	343 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	HR	O43593	1189 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	AP1G2	O75843	785 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	MTMR2	Q13614	643 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	HLA-C	Q95604	372 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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