RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
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NELFE-212ENST00000492539 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.78■■■□□ 2.52
NELFE-212ENST00000492539 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
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NELFE-212ENST00000492539 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
NELFE-212ENST00000492539 ROCK1Q13464 1354 aa30.73■■■□□ 2.51
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.72■■■□□ 2.51
NELFE-212ENST00000492539 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.72■■■□□ 2.51
NELFE-212ENST00000492539 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.71■■■□□ 2.51
NELFE-212ENST00000492539 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
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NELFE-212ENST00000492539 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
NELFE-212ENST00000492539 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
NELFE-212ENST00000492539 MSH6P52701 1360 aa30.61■■■□□ 2.49
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NELFE-212ENST00000492539 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
NELFE-212ENST00000492539 TBX22Q9Y458 520 aa30.58■■■□□ 2.49
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NELFE-212ENST00000492539 PIK3R4Q99570 1358 aa30.51■■■□□ 2.47
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NELFE-212ENST00000492539 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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NELFE-212ENST00000492539 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
NELFE-212ENST00000492539 TRPM2O94759 1503 aa30.47■■■□□ 2.47
NELFE-212ENST00000492539 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
NELFE-212ENST00000492539 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.44■■■□□ 2.46
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NELFE-212ENST00000492539 JCADQ9P266 1359 aa30.41■■■□□ 2.46
NELFE-212ENST00000492539 PTPRUQ92729 1446 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-212ENST00000492539 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.4■■■□□ 2.46
NELFE-212ENST00000492539 POTEAQ6S8J7 498 aa30.38■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.37■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 C14orf37Q86TY3 774 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.36■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.35■■■□□ 2.45
NELFE-212ENST00000492539 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
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NELFE-212ENST00000492539 ATF3P18847 181 aa30.31■■■□□ 2.44
NELFE-212ENST00000492539 DCCP43146 1447 aa30.3■■■□□ 2.44
NELFE-212ENST00000492539 SHPRHQ149N8 1683 aa30.3■■■□□ 2.44
NELFE-212ENST00000492539 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.29■■■□□ 2.44
NELFE-212ENST00000492539 KIF1BO60333 1816 aa30.28■■■□□ 2.44
NELFE-212ENST00000492539 NAIPQ13075 1403 aa30.28■■■□□ 2.44
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NELFE-212ENST00000492539 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.19■■■□□ 2.42
NELFE-212ENST00000492539 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.17■■■□□ 2.42
NELFE-212ENST00000492539 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.15■■■□□ 2.42
NELFE-212ENST00000492539 HFM1A2PYH4 1435 aa30.14■■■□□ 2.42
NELFE-212ENST00000492539 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.13■■■□□ 2.41
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NELFE-212ENST00000492539 PPLO60437 1756 aa30.08■■■□□ 2.41
NELFE-212ENST00000492539 PTCH1Q13635 1447 aa30.07■■■□□ 2.4
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NELFE-212ENST00000492539 TRIM52Q96A61 297 aa30.05■■■□□ 2.4
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NELFE-212ENST00000492539 LAMC1P11047 1609 aa30.02■■■□□ 2.4
NELFE-212ENST00000492539 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30■■■□□ 2.39
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NELFE-212ENST00000492539 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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NELFE-212ENST00000492539 RXRBP28702 533 aa29.91■■■□□ 2.38
NELFE-212ENST00000492539 IFT172Q9UG01 1749 aa29.9■■■□□ 2.38
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NELFE-212ENST00000492539 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
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NELFE-212ENST00000492539 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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NELFE-212ENST00000492539 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.85■■■□□ 2.37
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NELFE-212ENST00000492539 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
NELFE-212ENST00000492539 TECPR2O15040 1411 aa29.81■■■□□ 2.36
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