RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492536.5

RUSC1-215, Transcript of RUN and SH3 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RUSC1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-215ENST00000492536 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.92■■■■□ 3.34
RUSC1-215ENST00000492536 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.9■■■■□ 3.34
RUSC1-215ENST00000492536 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.89■■■■□ 3.34
RUSC1-215ENST00000492536 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.88■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 BCANQ96GW7 911 aa35.87■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 NWD1Q149M9 1564 aa35.84■■■■□ 3.33
RUSC1-215ENST00000492536 TMEM94Q12767 1356 aa35.82■■■■□ 3.32
RUSC1-215ENST00000492536 ILDR2Q71H61 639 aa35.81■■■■□ 3.32
RUSC1-215ENST00000492536 NAIPQ13075 1403 aa35.77■■■■□ 3.32
RUSC1-215ENST00000492536 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
RUSC1-215ENST00000492536 TBX22Q9Y458 520 aa35.75■■■■□ 3.31
RUSC1-215ENST00000492536 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.73■■■■□ 3.31
RUSC1-215ENST00000492536 DIP2AQ14689 1571 aa35.71■■■■□ 3.31
RUSC1-215ENST00000492536 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
RUSC1-215ENST00000492536 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
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RUSC1-215ENST00000492536 HFM1A2PYH4 1435 aa35.68■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.68■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.67■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 PIK3R4Q99570 1358 aa35.66■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 MSH6P52701 1360 aa35.64■■■■□ 3.3
RUSC1-215ENST00000492536 SOCS7O14512 581 aa35.63■■■■□ 3.29
RUSC1-215ENST00000492536 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
RUSC1-215ENST00000492536 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.61■■■■□ 3.29
RUSC1-215ENST00000492536 TRPM2O94759 1503 aa35.61■■■■□ 3.29
RUSC1-215ENST00000492536 CLTCL1P53675 1640 aa35.55■■■■□ 3.28
RUSC1-215ENST00000492536 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
RUSC1-215ENST00000492536 TRIM52Q96A61 297 aa35.54■■■■□ 3.28
RUSC1-215ENST00000492536 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.53■■■■□ 3.28
RUSC1-215ENST00000492536 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.53■■■■□ 3.28
RUSC1-215ENST00000492536 SLAIN2Q9P270 581 aa35.49■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.48■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 C14orf37Q86TY3 774 aa35.46■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.46■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.46■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 KIF1BO60333 1816 aa35.46■■■■□ 3.27
RUSC1-215ENST00000492536 PTPRUQ92729 1446 aa35.44■■■■□ 3.26
RUSC1-215ENST00000492536 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.43■■■■□ 3.26
RUSC1-215ENST00000492536 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.41■■■■□ 3.26
RUSC1-215ENST00000492536 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
RUSC1-215ENST00000492536 ATF3P18847 181 aa35.37■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 METP08581 1390 aa35.36■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 DCCP43146 1447 aa35.33■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.32■■■■□ 3.25
RUSC1-215ENST00000492536 PHLPP1O60346 1717 aa35.31■■■■□ 3.24
RUSC1-215ENST00000492536 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
RUSC1-215ENST00000492536 JCADQ9P266 1359 aa35.25■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.23■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.22■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 FOXD1Q16676 465 aa35.21■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.2■■■■□ 3.23
RUSC1-215ENST00000492536 PPLO60437 1756 aa35.19■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 PTCH1Q13635 1447 aa35.18■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 BRINP3Q76B58 766 aa35.16■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.15■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 MST1RQ04912 1400 aa35.15■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.14■■■■□ 3.22
RUSC1-215ENST00000492536 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.11■■■■□ 3.21
RUSC1-215ENST00000492536 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.11■■■■□ 3.21
RUSC1-215ENST00000492536 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.1■■■■□ 3.21
RUSC1-215ENST00000492536 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.1■■■■□ 3.21
RUSC1-215ENST00000492536 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.08■■■■□ 3.21
RUSC1-215ENST00000492536 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.07■■■■□ 3.2
RUSC1-215ENST00000492536 RGL3Q3MIN7 710 aa35.05■■■■□ 3.2
RUSC1-215ENST00000492536 SHPRHQ149N8 1683 aa35.05■■■■□ 3.2
RUSC1-215ENST00000492536 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.03■■■■□ 3.2
RUSC1-215ENST00000492536 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.01■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 IFT172Q9UG01 1749 aa35.01■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 POTEAQ6S8J7 498 aa34.99■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.99■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 LRP6O75581 1613 aa34.97■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.97■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 PIK3C2GO75747 1445 aa34.95■■■■□ 3.19
RUSC1-215ENST00000492536 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
RUSC1-215ENST00000492536 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
RUSC1-215ENST00000492536 TECPR2O15040 1411 aa34.91■■■■□ 3.18
RUSC1-215ENST00000492536 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
RUSC1-215ENST00000492536 LAMC1P11047 1609 aa34.87■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.87■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 ABCC11Q96J66 1382 aa34.87■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 MYOM2P54296 1465 aa34.84■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.84■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 STK26Q9P289 416 aa34.83■■■■□ 3.17
RUSC1-215ENST00000492536 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.83■■■■□ 3.17
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