RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489235.2

SRIP1-201, Transcript of sorcin pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SRIP1, Length 288 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP1-201ENST00000489235 NBPF3Q9H094 633 aa4.93□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.93□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 CECR2Q9BXF3 1484 aa4.93□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 OATP04181 439 aa4.92□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SRIP1-201ENST00000489235 AK7Q96M32 723 aa4.92□□□□□ -1.62
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SRIP1-201ENST00000489235 RDH13Q8NBN7 331 aa4.79□□□□□ -1.64
SRIP1-201ENST00000489235 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.79□□□□□ -1.64
SRIP1-201ENST00000489235 HLA-CQ95604 372 aa4.79□□□□□ -1.64
SRIP1-201ENST00000489235 HCSTQ9UBK5 93 aa4.79□□□□□ -1.64
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SRIP1-201ENST00000489235 KDM4AO75164 1064 aa4.77□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 GUCA2AQ02747 115 aa4.77□□□□□ -1.65
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SRIP1-201ENST00000489235 MOXD2PA6NHM9 499 aa4.76□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.76□□□□□ -1.65
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SRIP1-201ENST00000489235 ZNF516Q92618 1163 aa4.76□□□□□ -1.65
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SRIP1-201ENST00000489235 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 TBC1D2Q9BYX2 928 aa4.76□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 PCDHGC3Q9UN70 934 aa4.76□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 NDUFV2P19404 249 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 ATP6V1AP38606 617 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 NECTIN2Q92692 538 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.75□□□□□ -1.65
SRIP1-201ENST00000489235 SPTLC1O15269 473 aa4.74□□□□□ -1.65
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