RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 ROCK1Q13464 1354 aa36.4■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNA6P17658 529 aa36.38■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 E9PCH4 1651 aa36.36■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM94Q12767 1356 aa36.35■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.33■■■■□ 3.41
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.32■■■■□ 3.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.32■■■■□ 3.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUP155O75694 1391 aa36.31■■■■□ 3.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZFYVE9O95405 1425 aa36.28■■■■□ 3.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.27■■■■□ 3.4
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
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PRKRIP1-205ENST00000477886 NWD1Q149M9 1564 aa36.23■■■■□ 3.39
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
PRKRIP1-205ENST00000477886 MSH6P52701 1360 aa36.17■■■■□ 3.38
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PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.16■■■■□ 3.38
PRKRIP1-205ENST00000477886 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.15■■■■□ 3.38
PRKRIP1-205ENST00000477886 TBX22Q9Y458 520 aa36.12■■■■□ 3.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 C14orf37Q86TY3 774 aa36.11■■■■□ 3.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.08■■■■□ 3.37
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
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PRKRIP1-205ENST00000477886 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.04■■■■□ 3.36
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PRKRIP1-205ENST00000477886 TRPM2O94759 1503 aa35.99■■■■□ 3.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 PIK3R4Q99570 1358 aa35.96■■■■□ 3.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 PHLPP1O60346 1717 aa35.96■■■■□ 3.35
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM52Q96A61 297 aa35.94■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.94■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 NAIPQ13075 1403 aa35.93■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.92■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATF3P18847 181 aa35.91■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 CLTCL1P53675 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
PRKRIP1-205ENST00000477886 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.87■■■■□ 3.33
PRKRIP1-205ENST00000477886 PTPRUQ92729 1446 aa35.87■■■■□ 3.33
PRKRIP1-205ENST00000477886 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.87■■■■□ 3.33
PRKRIP1-205ENST00000477886 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
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PRKRIP1-205ENST00000477886 KIF1BO60333 1816 aa35.85■■■■□ 3.33
PRKRIP1-205ENST00000477886 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.84■■■■□ 3.33
PRKRIP1-205ENST00000477886 JCADQ9P266 1359 aa35.8■■■■□ 3.32
PRKRIP1-205ENST00000477886 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.78■■■■□ 3.32
PRKRIP1-205ENST00000477886 HFM1A2PYH4 1435 aa35.78■■■■□ 3.32
PRKRIP1-205ENST00000477886 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
PRKRIP1-205ENST00000477886 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
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PRKRIP1-205ENST00000477886 METP08581 1390 aa35.76■■■■□ 3.31
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PRKRIP1-205ENST00000477886 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
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PRKRIP1-205ENST00000477886 DCCP43146 1447 aa35.66■■■■□ 3.3
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PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.61■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.59■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.59■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 SHPRHQ149N8 1683 aa35.59■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 MST1RQ04912 1400 aa35.58■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.58■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 LRP6O75581 1613 aa35.57■■■■□ 3.29
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.57■■■■□ 3.28
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PRKRIP1-205ENST00000477886 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPLO60437 1756 aa35.54■■■■□ 3.28
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PRKRIP1-205ENST00000477886 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.49■■■■□ 3.27
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PRKRIP1-205ENST00000477886 PTCH1Q13635 1447 aa35.47■■■■□ 3.27
PRKRIP1-205ENST00000477886 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.46■■■■□ 3.27
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PRKRIP1-205ENST00000477886 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.45■■■■□ 3.27
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PRKRIP1-205ENST00000477886 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.31■■■■□ 3.24
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PRKRIP1-205ENST00000477886 AFF2P51816 1311 aa35.31■■■■□ 3.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.3■■■■□ 3.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 C8orf37Q96NL8 207 aa35.3■■■■□ 3.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 RXRBP28702 533 aa35.28■■■■□ 3.24
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.25■■■■□ 3.23
PRKRIP1-205ENST00000477886 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.24■■■■□ 3.23
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADAMTS2O95450 1211 aa35.23■■■■□ 3.23
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