RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 UNC13BO14795 1591 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM94Q12767 1356 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 ROCK1Q13464 1354 aa25.45■■□□□ 1.67
SH3BP5-207ENST00000450625 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 E9PCH4 1651 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 ZFYVE9O95405 1425 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5-207ENST00000450625 NUP155O75694 1391 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 NWD1Q149M9 1564 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 MSH6P52701 1360 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5-207ENST00000450625 TBX22Q9Y458 520 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP5-207ENST00000450625 SLAIN2Q9P270 581 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-207ENST00000450625 C14orf37Q86TY3 774 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP5-207ENST00000450625 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 DIP2AQ14689 1571 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 PHLPP1O60346 1717 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-207ENST00000450625 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 PIK3R4Q99570 1358 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 TRPM2O94759 1503 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 ATF3P18847 181 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-207ENST00000450625 PTPRUQ92729 1446 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 JCADQ9P266 1359 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 NAIPQ13075 1403 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 POTEAQ6S8J7 498 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 CLTCL1P53675 1640 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 TRIM52Q96A61 297 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 KIF1BO60333 1816 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5-207ENST00000450625 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5-207ENST00000450625 METP08581 1390 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5-207ENST00000450625 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-207ENST00000450625 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 BRINP3Q76B58 766 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 DCCP43146 1447 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 HFM1A2PYH4 1435 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 SHPRHQ149N8 1683 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-207ENST00000450625 LRP6O75581 1613 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 MST1RQ04912 1400 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 FOXD1Q16676 465 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-207ENST00000450625 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 PPLO60437 1756 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 PTCH1Q13635 1447 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-207ENST00000450625 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 RGL3Q3MIN7 710 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 RXRBP28702 533 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 ORAI2Q96SN7 254 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 AFF2P51816 1311 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-207ENST00000450625 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-207ENST00000450625 C8orf37Q96NL8 207 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-207ENST00000450625 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-207ENST00000450625 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5-207ENST00000450625 STK26Q9P289 416 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-207ENST00000450625 ADAMTS2O95450 1211 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-207ENST00000450625 LAMC1P11047 1609 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-207ENST00000450625 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-207ENST00000450625 IFT172Q9UG01 1749 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-207ENST00000450625 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-207ENST00000450625 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms