RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448576.6

GATAD2A-209, Transcript of GATA zinc finger domain containing 2A, human

TSL 3

Gene GATAD2A, Length 271 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GATAD2A-209	ENST00000448576	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.4	■■■■■ 4.54
GATAD2A-209	ENST00000448576	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.39	■■■■■ 4.54
GATAD2A-209	ENST00000448576	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.38	■■■■■ 4.53
GATAD2A-209	ENST00000448576	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.38	■■■■■ 4.53
GATAD2A-209	ENST00000448576	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.33	■■■■■ 4.53
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	KCNA6	P17658	529 aa		43.31	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.28	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.28	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
GATAD2A-209	ENST00000448576	NAIP	Q13075	1403 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GATAD2A-209	ENST00000448576	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
GATAD2A-209	ENST00000448576	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
GATAD2A-209	ENST00000448576	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.2	■■■■■ 4.51
GATAD2A-209	ENST00000448576	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.19	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.16	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.15	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.15	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
GATAD2A-209	ENST00000448576	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
GATAD2A-209	ENST00000448576	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
GATAD2A-209	ENST00000448576	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.1	■■■■■ 4.49
GATAD2A-209	ENST00000448576	HFM1	A2PYH4	1435 aa		43.09	■■■■■ 4.49
GATAD2A-209	ENST00000448576	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.08	■■■■■ 4.49
GATAD2A-209	ENST00000448576	TRPM2	O94759	1503 aa		43.07	■■■■■ 4.48
GATAD2A-209	ENST00000448576	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.06	■■■■■ 4.48
GATAD2A-209	ENST00000448576	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.05	■■■■■ 4.48
GATAD2A-209	ENST00000448576	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.05	■■■■■ 4.48
GATAD2A-209	ENST00000448576	SOCS7	O14512	581 aa		43	■■■■■ 4.47
GATAD2A-209	ENST00000448576	MSH6	P52701	1360 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GATAD2A-209	ENST00000448576	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GATAD2A-209	ENST00000448576	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.98	■■■■■ 4.47
GATAD2A-209	ENST00000448576	KIF1B	O60333	1816 aa		42.97	■■■■■ 4.47
GATAD2A-209	ENST00000448576	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.94	■■■■■ 4.46
GATAD2A-209	ENST00000448576	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.92	■■■■■ 4.46
GATAD2A-209	ENST00000448576	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.9	■■■■■ 4.46
GATAD2A-209	ENST00000448576	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
GATAD2A-209	ENST00000448576	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
GATAD2A-209	ENST00000448576	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
GATAD2A-209	ENST00000448576	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.83	■■■■■ 4.45
GATAD2A-209	ENST00000448576	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.8	■■■■■ 4.44
GATAD2A-209	ENST00000448576	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.79	■■■■■ 4.44
GATAD2A-209	ENST00000448576	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.78	■■■■■ 4.44
GATAD2A-209	ENST00000448576	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	MET	P08581	1390 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.71	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	PPL	O60437	1756 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GATAD2A-209	ENST00000448576	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
GATAD2A-209	ENST00000448576	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GATAD2A-209	ENST00000448576	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GATAD2A-209	ENST00000448576	DCC	P43146	1447 aa		42.63	■■■■■ 4.42
GATAD2A-209	ENST00000448576	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
GATAD2A-209	ENST00000448576	FOXD1	Q16676	465 aa		42.6	■■■■■ 4.41
GATAD2A-209	ENST00000448576	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.6	■■■■■ 4.41
GATAD2A-209	ENST00000448576	ATF3	P18847	181 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GATAD2A-209	ENST00000448576	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
GATAD2A-209	ENST00000448576	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GATAD2A-209	ENST00000448576	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GATAD2A-209	ENST00000448576	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GATAD2A-209	ENST00000448576	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
GATAD2A-209	ENST00000448576	MST1R	Q04912	1400 aa		42.51	■■■■■ 4.4
GATAD2A-209	ENST00000448576	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.47	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.45	■■■■■ 4.39
GATAD2A-209	ENST00000448576	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.44	■■■■■ 4.38
GATAD2A-209	ENST00000448576	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GATAD2A-209	ENST00000448576	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GATAD2A-209	ENST00000448576	LRP6	O75581	1613 aa		42.38	■■■■■ 4.38
GATAD2A-209	ENST00000448576	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.33	■■■■■ 4.37
GATAD2A-209	ENST00000448576	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.32	■■■■■ 4.37
GATAD2A-209	ENST00000448576	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GATAD2A-209	ENST00000448576	LAMC1	P11047	1609 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GATAD2A-209	ENST00000448576	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.23	■■■■■ 4.35
GATAD2A-209	ENST00000448576	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.22	■■■■■ 4.35
GATAD2A-209	ENST00000448576	TECPR2	O15040	1411 aa		42.19	■■■■■ 4.34
GATAD2A-209	ENST00000448576	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.18	■■■■■ 4.34
GATAD2A-209	ENST00000448576	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
GATAD2A-209	ENST00000448576	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.11	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	MYOM2	P54296	1465 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.08	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.07	■■■■■ 4.33
GATAD2A-209	ENST00000448576	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.06	■■■■■ 4.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms