RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 UNC13BO14795 1591 aa15.78■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
SH3BP4-206ENST00000446904 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP155O75694 1391 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFYVE9O95405 1425 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.76■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP4-206ENST00000446904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.72■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 E9PCH4 1651 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.71■□□□□ 0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.7■□□□□ 0.1
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SH3BP4-206ENST00000446904 TBX22Q9Y458 520 aa15.69■□□□□ 0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 NWD1Q149M9 1564 aa15.69■□□□□ 0.1
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SH3BP4-206ENST00000446904 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf37Q86TY3 774 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 NAIPQ13075 1403 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.6■□□□□ 0.09
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SH3BP4-206ENST00000446904 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.58■□□□□ 0.08
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SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPM2O94759 1503 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 HFM1A2PYH4 1435 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 CLTCL1P53675 1640 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 METP08581 1390 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 JCADQ9P266 1359 aa15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP4-206ENST00000446904 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP4-206ENST00000446904 POTEAQ6S8J7 498 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
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SH3BP4-206ENST00000446904 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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SH3BP4-206ENST00000446904 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 MST1RQ04912 1400 aa15.44■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
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SH3BP4-206ENST00000446904 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 LRP6O75581 1613 aa15.43■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.42■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.41■□□□□ 0.06
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SH3BP4-206ENST00000446904 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 ADRA2BP18089 450 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4-206ENST00000446904 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
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SH3BP4-206ENST00000446904 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.36■□□□□ 0.05
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SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.34■□□□□ 0.05
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SH3BP4-206ENST00000446904 STK26Q9P289 416 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4-206ENST00000446904 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 AFF2P51816 1311 aa15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 C8orf37Q96NL8 207 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SH3BP4-206ENST00000446904 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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