RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.86■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUP155O75694 1391 aa29.84■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.83■■■□□ 2.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NWD1Q149M9 1564 aa29.82■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.82■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMEM94Q12767 1356 aa29.8■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SOCS7O14512 581 aa29.8■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BCANQ96GW7 911 aa29.76■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.75■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.71■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TBX22Q9Y458 520 aa29.71■■■□□ 2.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.68■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.66■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DIP2AQ14689 1571 aa29.66■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NAIPQ13075 1403 aa29.66■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MSH6P52701 1360 aa29.62■■■□□ 2.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PIK3R4Q99570 1358 aa29.62■■■□□ 2.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.6■■■□□ 2.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.6■■■□□ 2.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HFM1A2PYH4 1435 aa29.55■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRPM2O94759 1503 aa29.55■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLAIN2Q9P270 581 aa29.53■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CLTCL1P53675 1640 aa29.53■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.53■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.52■■■□□ 2.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PTPRUQ92729 1446 aa29.5■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.47■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.46■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.45■■■□□ 2.31
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF1BO60333 1816 aa29.43■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C14orf37Q86TY3 774 aa29.43■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRIM52Q96A61 297 aa29.43■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.42■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PHLPP1O60346 1717 aa29.4■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 METP08581 1390 aa29.39■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATF3P18847 181 aa29.38■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DCCP43146 1447 aa29.36■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-202ENST00000432502 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-202ENST00000432502 JCADQ9P266 1359 aa29.34■■■□□ 2.29
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.3■■■□□ 2.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BRINP3Q76B58 766 aa29.26■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.25■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPLO60437 1756 aa29.24■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MST1RQ04912 1400 aa29.24■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FOXD1Q16676 465 aa29.22■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PTCH1Q13635 1447 aa29.21■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.21■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POTEAQ6S8J7 498 aa29.21■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.2■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.2■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.2■■■□□ 2.27
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SHPRHQ149N8 1683 aa29.19■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.18■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.18■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRP6O75581 1613 aa29.16■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.15■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.15■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.15■■■□□ 2.26
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.12■■■□□ 2.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.09■■■□□ 2.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.09■■■□□ 2.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 IFT172Q9UG01 1749 aa29.08■■■□□ 2.25
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.07■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RGL3Q3MIN7 710 aa29.06■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LAMC1P11047 1609 aa29.03■■■□□ 2.24
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TECPR2O15040 1411 aa29■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PIK3C2GO75747 1445 aa29■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.97■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.96■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ORAI2Q96SN7 254 aa28.96■■■□□ 2.23
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.96■■■□□ 2.23
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