RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
LMO1-202ENST00000428101 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.44■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 KCNA6P17658 529 aa41.42■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.38■■■■■ 4.22
LMO1-202ENST00000428101 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 ILDR2Q71H61 639 aa41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 BCANQ96GW7 911 aa41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 NAIPQ13075 1403 aa41.35■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 TMEM94Q12767 1356 aa41.32■■■■■ 4.21
LMO1-202ENST00000428101 NWD1Q149M9 1564 aa41.31■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.3■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.28■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
LMO1-202ENST00000428101 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 TBX22Q9Y458 520 aa41.23■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 HFM1A2PYH4 1435 aa41.2■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.2■■■■■ 4.19
LMO1-202ENST00000428101 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
LMO1-202ENST00000428101 DIP2AQ14689 1571 aa41.12■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.1■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 CLTCL1P53675 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 TRPM2O94759 1503 aa41.09■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 TRIM52Q96A61 297 aa41.07■■■■■ 4.17
LMO1-202ENST00000428101 PIK3R4Q99570 1358 aa41.06■■■■■ 4.16
LMO1-202ENST00000428101 MSH6P52701 1360 aa41.04■■■■■ 4.16
LMO1-202ENST00000428101 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
LMO1-202ENST00000428101 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.02■■■■■ 4.16
LMO1-202ENST00000428101 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 SOCS7O14512 581 aa40.99■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 KIF1BO60333 1816 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 PTPRUQ92729 1446 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.98■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.95■■■■■ 4.15
LMO1-202ENST00000428101 SLAIN2Q9P270 581 aa40.94■■■■■ 4.14
LMO1-202ENST00000428101 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.94■■■■■ 4.14
LMO1-202ENST00000428101 C14orf37Q86TY3 774 aa40.86■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 METP08581 1390 aa40.86■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.84■■■■■ 4.13
LMO1-202ENST00000428101 FOXD1Q16676 465 aa40.81■■■■■ 4.12
LMO1-202ENST00000428101 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
LMO1-202ENST00000428101 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.78■■■■■ 4.12
LMO1-202ENST00000428101 ATF3P18847 181 aa40.75■■■■■ 4.11
LMO1-202ENST00000428101 PHLPP1O60346 1717 aa40.75■■■■■ 4.11
LMO1-202ENST00000428101 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
LMO1-202ENST00000428101 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.73■■■■■ 4.11
LMO1-202ENST00000428101 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.72■■■■■ 4.11
LMO1-202ENST00000428101 PPLO60437 1756 aa40.69■■■■■ 4.1
LMO1-202ENST00000428101 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
LMO1-202ENST00000428101 DCCP43146 1447 aa40.66■■■■■ 4.1
LMO1-202ENST00000428101 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
LMO1-202ENST00000428101 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
LMO1-202ENST00000428101 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.63■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.61■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 JCADQ9P266 1359 aa40.59■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.58■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 BRINP3Q76B58 766 aa40.57■■■■■ 4.09
LMO1-202ENST00000428101 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.57■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 MST1RQ04912 1400 aa40.55■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.55■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 PTCH1Q13635 1447 aa40.53■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 RGL3Q3MIN7 710 aa40.53■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.51■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.51■■■■■ 4.08
LMO1-202ENST00000428101 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.5■■■■■ 4.07
LMO1-202ENST00000428101 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.48■■■■■ 4.07
LMO1-202ENST00000428101 IFT172Q9UG01 1749 aa40.48■■■■■ 4.07
LMO1-202ENST00000428101 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.46■■■■■ 4.07
LMO1-202ENST00000428101 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.44■■■■■ 4.06
LMO1-202ENST00000428101 SHPRHQ149N8 1683 aa40.4■■■■■ 4.06
LMO1-202ENST00000428101 POTEAQ6S8J7 498 aa40.4■■■■■ 4.06
LMO1-202ENST00000428101 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.4■■■■■ 4.06
LMO1-202ENST00000428101 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.39■■■■■ 4.06
LMO1-202ENST00000428101 LRP6O75581 1613 aa40.37■■■■■ 4.05
LMO1-202ENST00000428101 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.35■■■■■ 4.05
LMO1-202ENST00000428101 PIK3C2GO75747 1445 aa40.33■■■■■ 4.05
LMO1-202ENST00000428101 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
LMO1-202ENST00000428101 TECPR2O15040 1411 aa40.26■■■■■ 4.04
LMO1-202ENST00000428101 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
LMO1-202ENST00000428101 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.26■■■■■ 4.04
LMO1-202ENST00000428101 STK26Q9P289 416 aa40.26■■■■■ 4.04
LMO1-202ENST00000428101 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 ORAI2Q96SN7 254 aa40.24■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 ABCC11Q96J66 1382 aa40.23■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.22■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 LAMC1P11047 1609 aa40.22■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.21■■■■■ 4.03
LMO1-202ENST00000428101 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.21■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms