RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTRQ99707 1265 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-601P-201ENST00000384540 IL21Q9HBE4 155 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR14Q9BWN1 585 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 FECHP22830 423 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF516Q92618 1163 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFHP08603 1231 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC10A3P09131 477 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 COPS2P61201 443 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZPR1O75312 459 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP2K5Q13163 448 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHOX2BQ99453 314 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 GGCXP38435 758 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 NLRP7Q8WX94 980 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 TLL1O43897 1013 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 NR1I2O75469 434 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 SULF1Q8IWU6 871 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 RDH13Q8NBN7 331 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 IRF6O14896 467 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADH1BP00325 375 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC102AQ96A19 550 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-601P-201ENST00000384540 GCGRP47871 477 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF223E7ERA6 249 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD46P15529 392 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 FUT2Q10981 343 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 MORN1Q5T089 497 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 S1PR4O95977 384 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP6V1AP38606 617 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 LAPTM4AQ15012 233 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 BARGINQ6ZT62 677 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 THAP11Q96EK4 314 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZMYND10O75800 440 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLCN1P35523 988 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPSB2Q99619 263 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-601P-201ENST00000384540 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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RNU6-601P-201ENST00000384540 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC19A1P41440 591 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 GFRA3O60609 400 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 KDM4AO75164 1064 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 USP46P62068 366 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 MSS51Q4VC12 460 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 BRICD5Q6PL45 260 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 AMHR2Q16671 573 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPRYD7Q5W111 196 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q6ZNB5 142 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 HOXA2O43364 376 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q3C1V9 767 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-601P-201ENST00000384540 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPIAP49247 311 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR20EP86478 221 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR20CP86479 221 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR20DP86480 221 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR20BP86481 221 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR20AP86496 221 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 HLA-CQ95604 372 aa7.07□□□□□ -1.28
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