RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-641P-201ENST00000384006 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-641P-201ENST00000384006 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-641P-201ENST00000384006 NECTIN2Q92692 538 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC4A3P48751 1232 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLF2Q8IX21 1173 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 NLRP7Q8WX94 980 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 MS4A1P11836 297 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD46P15529 392 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 STAC3Q96MF2 364 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRCH3Q96II8 777 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 WNT2BQ93097 391 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM117AQ9C073 453 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 GOPCQ9HD26 462 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC10A3P09131 477 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 GCGRP47871 477 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 USP46P62068 366 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRR14Q9BWN1 585 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 GJA5P36382 358 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 RDH13Q8NBN7 331 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 BCAMP50895 628 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 CFHP08603 1231 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF40O75150 1001 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 KDM4AO75164 1064 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL27Q8NEV9 243 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-641P-201ENST00000384006 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP4CP60510 307 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 HOXA2O43364 376 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPTLC1O15269 473 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 WBP1LQ9NX94 342 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 APLP1P51693 650 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATP6V1AP38606 617 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 FUT2Q10981 343 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 MORN1Q5T089 497 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 HCSTQ9UBK5 93 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-641P-201ENST00000384006 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 MMRN1Q13201 1228 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 FDX1P10109 184 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 LIMD1Q9UGP4 676 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 NR1I2O75469 434 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 NDUFV2P19404 249 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PTPN5P54829 565 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 Q3C1V9 767 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 LILRB3O75022 631 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 IL21Q9HBE4 155 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-641P-201ENST00000384006 GUCA2AQ02747 115 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 HLA-CQ95604 372 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-641P-201ENST00000384006 THAP11Q96EK4 314 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms