RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU6-534P-201ENST00000364877 OATP04181 439 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-534P-201ENST00000364877 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRR14Q9BWN1 585 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-534P-201ENST00000364877 GPR37O15354 613 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 FECHP22830 423 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF516Q92618 1163 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 CFHP08603 1231 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLC10A3P09131 477 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZPR1O75312 459 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 NLRP7Q8WX94 980 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 GGCXP38435 758 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 RDH13Q8NBN7 331 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 TLL1O43897 1013 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RNU6-534P-201ENST00000364877 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 PHOX2BQ99453 314 aa8.71□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP2K5Q13163 448 aa8.7□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 NR1I2O75469 434 aa8.69□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 SULF1Q8IWU6 871 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.68□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 RNF223E7ERA6 249 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 IRF6O14896 467 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 S1PR4O95977 384 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 ADH1BP00325 375 aa8.65□□□□□ -1.02
RNU6-534P-201ENST00000364877 FUT2Q10981 343 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 GCGRP47871 477 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 Q6ZNB5 142 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCDC102AQ96A19 550 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 GFRA3O60609 400 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATP6V1AP38606 617 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 LAPTM4AQ15012 233 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 MORN1Q5T089 497 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPSB2Q99619 263 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLC19A1P41440 591 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-534P-201ENST00000364877 CD46P15529 392 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 THAP11Q96EK4 314 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLCN1P35523 988 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 KDM4AO75164 1064 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRYD7Q5W111 196 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 BRICD5Q6PL45 260 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZMYND10O75800 440 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 BARGINQ6ZT62 677 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP46P62068 366 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 Q3C1V9 767 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 HLA-CQ95604 372 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 HOXA2O43364 376 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 MSS51Q4VC12 460 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 LCE2BO14633 110 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 TNFRSF10AO00220 468 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 GUCA2AQ02747 115 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-534P-201ENST00000364877 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-534P-201ENST00000364877 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms