RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 S1PR4O95977 384 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 TLL1O43897 1013 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 GMPRP36959 345 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS12P56730 875 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFSD10Q14728 455 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLF2Q8IX21 1173 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP3K7O43318 606 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM47Q96LD4 638 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR14Q9BWN1 585 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 SENP2Q9HC62 589 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP4X1Q8N118 509 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX12PQ92771 950 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBR1Q14596 966 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 CERKQ8TCT0 537 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC4A3P48751 1232 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKD2Q13563 968 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRF7Q92985 503 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIFC2Q96AC6 838 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPYSL4O14531 572 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNMA1Q12791 1236 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 XP32Q5T750 250 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADH1BP00325 375 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.03□□□□□ -1.76
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPIAP49247 311 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSK3AP49840 483 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDF11O95390 407 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMPD1P17405 629 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 VEGFBP49765 207 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 CAMK2BQ13554 666 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERBB4Q15303 1308 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BM21 787 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 KMT5BQ4FZB7 885 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR1I2O75469 434 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 RASSF7Q02833 373 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC13Q8NBP0 860 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDHR5Q9HBB8 845 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 J3QL48 77 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDIA6Q15084 440 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PADI6Q6TGC4 694 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 HPS1Q92902 700 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 WNT7AO00755 349 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFHP08603 1231 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 EYA1Q99502 592 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPSB2Q99619 263 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHA1P01876 353 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCUBE3Q8IX30 993 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRXCR2A6NFK2 248 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNAJB2P25686 324 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CADPS2Q86UW7 1296 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRGPRX2Q96LB1 330 aa3.91□□□□□ -1.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 VSIG8P0DPA2 414 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 BMP1P13497 986 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 OSBPP22059 807 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC10A3P09131 477 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXK2Q01167 660 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.88□□□□□ -1.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms