RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 ZFYVE9O95405 1425 aa34.72■■■■□ 3.15
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CLTB-202ENST00000345807 SOCS7O14512 581 aa34.69■■■■□ 3.14
CLTB-202ENST00000345807 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.69■■■■□ 3.14
CLTB-202ENST00000345807 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
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CLTB-202ENST00000345807 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
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CLTB-202ENST00000345807 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
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CLTB-202ENST00000345807 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.59■■■■□ 3.13
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CLTB-202ENST00000345807 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.52■■■■□ 3.12
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CLTB-202ENST00000345807 MSH6P52701 1360 aa34.47■■■■□ 3.11
CLTB-202ENST00000345807 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
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CLTB-202ENST00000345807 HFM1A2PYH4 1435 aa34.3■■■■□ 3.08
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CLTB-202ENST00000345807 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.24■■■■□ 3.07
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CLTB-202ENST00000345807 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.66■■■□□ 2.98
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