RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602710.5

UBE2E3-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-209ENST00000602710 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3-209ENST00000602710 PTPRSQ13332 1948 aa20.52■□□□□ 0.88
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UBE2E3-209ENST00000602710 DDHD2O94830 711 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 WDR44Q5JSH3 913 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 NT5C1BQ96P26 610 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 HOXA2O43364 376 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 DGKIO75912 1065 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 CLSTN1O94985 981 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 CASP14P31944 242 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 KCNJ6P48051 423 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 IQCEQ6IPM2 695 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 KAT5Q92993 513 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 HPDLQ96IR7 371 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 HCSTQ9UBK5 93 aa20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.874e-6■■■□□ 17
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UBE2E3-209ENST00000602710 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 TUSC3Q13454 348 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF699Q32M78 642 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 FIGNQ5HY92 759 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 DSC1Q08554 894 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ARID5BQ14865 1188 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 HERVK_113Q902F9 699 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 CEP72Q9P209 647 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 POLIQ9UNA4 740 aa20.49■□□□□ 0.87
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UBE2E3-209ENST00000602710 SPTLC1O15269 473 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ATICP31939 592 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 TRIM14Q14142 442 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 UPP1Q16831 310 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 BAP1Q92560 729 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 TAF4BQ92750 862 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ARID3AQ99856 593 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 A0A1W2PQJ5 194 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 PODXLO00592 558 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 F8W810 466 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 KRT9P35527 623 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 LILRA4P59901 499 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 MYO1EQ12965 1108 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 TC2NQ8N9U0 490 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 IQCDQ96DY2 449 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3-209ENST00000602710 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.46■□□□□ 0.87
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