RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CST8O60676 142 aa17.49■□□□□ 0.39
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAPGEF5Q92565 580 aa17.47■□□□□ 0.39
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 20.8
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFIBO00712 420 aa17.46■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBP5P82980 135 aa17.46■□□□□ 0.39
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CARD9Q9H257 536 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPHS2Q9NP85 383 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf81C9J6K1 198 aa17.45■□□□□ 0.38
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHEK2O96017 543 aa17.45■□□□□ 0.38
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