RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 TPGS2Q68CL5 300 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 ZNF720Q7Z2F6 126 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 PRSS33Q8NF86 280 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 DDX12PQ92771 950 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 CDH7Q9ULB5 785 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 CACNA1HO95180 2353 aa29.02■■■□□ 2.24
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF37A1IGU5 675 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 ANHXE9PGG2 379 aa29.01■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 SLC39A4Q6P5W5 647 aa29.01■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 SFR1Q86XK3 245 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 FBXL5Q9UKA1 691 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 FBXL21Q9UKT6 434 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 DERAQ9Y315 318 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 STYXL1Q9Y6J8 313 aa29.01■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 WDR27A2RRH5 827 aa29■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 STK38Q15208 465 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 HSCBQ8IWL3 235 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 TCEAL8Q8IYN2 117 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 SLC44A3Q8N4M1 653 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 BEST2Q8NFU1 509 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 WNT16Q9UBV4 365 aa29■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 EXOC7Q9UPT5 735 aa29■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 PPP1R37O75864 691 aa28.99■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 LRG1P02750 347 aa28.99■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 SPAG1Q07617 926 aa28.99■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 HTR4Q13639 388 aa28.99■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 ADALQ6DHV7 355 aa28.99■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 MTSS1LQ765P7 747 aa28.99■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 ASB7Q9H672 318 aa28.99■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.98■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 OLFML3Q9NRN5 406 aa28.98■■■□□ 2.23
ODC1-204ENST00000446285 NOTCH4Q99466 2003 aa28.98■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 OAZ2O95190 189 aa28.97■■■□□ 2.23
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ODC1-204ENST00000446285 TMEM105Q8N8V8 129 aa28.95■■■□□ 2.22
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ODC1-204ENST00000446285 OR6C75A6NL08 312 aa28.94■■■□□ 2.22
ODC1-204ENST00000446285 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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ODC1-204ENST00000446285 FLCNQ8NFG4 579 aa28.94■■■□□ 2.22
ODC1-204ENST00000446285 ITFG1Q8TB96 612 aa28.94■■■□□ 2.22
ODC1-204ENST00000446285 RTP3Q9BQQ7 232 aa28.94■■■□□ 2.22
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