RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 TEKT1Q969V4 418 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 LENG9Q96B70 501 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 KREMEN1Q96MU8 473 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GBP5Q96PP8 586 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 KIFC3Q9BVG8 833 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 WHRNQ9P202 907 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ASMTLO95671 621 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SMARCA1P28370 1054 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MXI1P50539 228 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 NEK3P51956 506 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FMO1Q01740 532 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SEMA4DQ92854 862 aa12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ROBO3Q96MS0 1386 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DCTN3O75935 186 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SERPINB3P29508 390 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DYNLT1P63172 113 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 LMO3Q8TAP4 145 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PLEKHO2Q8TD55 490 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DCLK3Q9C098 648 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 LRRC19Q9H756 370 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GPRC5CQ9NQ84 441 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 STOML1Q9UBI4 398 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 NEU2Q9Y3R4 380 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ARAP2Q8WZ64 1704 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GH2P01242 217 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 KITP10721 976 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GPS1Q13098 491 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 RHBDF2Q6PJF5 856 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.472e-10■■□□□ 13.6
TOMM20-201ENST00000366607 HIPK4Q8NE63 616 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ATL2Q8NHH9 583 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CD101Q93033 1021 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FAM161BQ96MY7 647 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DLEC1Q9Y238 1755 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FRMPD4Q14CM0 1322 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GAS7O60861 476 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 USP1O94782 785 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CYP3A4P08684 503 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SSTR1P30872 391 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 TRABD2AQ86V40 505 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FBXO11Q86XK2 927 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 KIFAP3Q92845 792 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 TTC17Q96AE7 1141 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DCLRE1BQ9H816 532 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.12□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MYH11P35749 1972 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 H0YIN7 160 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 BBOX1O75936 387 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CYP11B1P15538 503 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 AMPD1P23109 780 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PTPN4P29074 926 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SHMT1P34896 483 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 VHLP40337 213 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PPP2R5CQ13362 524 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 DGKZQ13574 1117 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CLNKQ7Z7G1 428 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 JDP2Q8WYK2 163 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF333Q96JL9 665 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 EPAS1Q99814 870 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PLVAPQ9BX97 442 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SLC17A7Q9P2U7 560 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 SKIP12755 728 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 KDSRQ06136 332 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 MOGSQ13724 837 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PARP6Q2NL67 630 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 CFAP157Q5JU67 520 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 FYB2Q5VWT5 728 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.11□□□□□ -0.47
TOMM20-201ENST00000366607 C10orf82Q8WW14 230 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms