RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520746.1

HDAC2-208, Transcript of histone deacetylase 2, human

TSL 3

Gene HDAC2, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC2-208	ENST00000520746	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PPARA	Q07869	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CLUL1	Q15846	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	1e-7	■■□□□ 13.1
HDAC2-208	ENST00000520746	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746		A0A1W2PR48	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ESRRB	O95718	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	C1R	P00736	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MPL	P40238	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CDK17	Q00537	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TNKS	O95271	1327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	NRP2	O60462	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CCND1	P24385	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	GPR15	P49685	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MPP3	Q13368	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	OSM	P13725	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MTHFD2	P13995	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	NRG3	P56975	720 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	APBA1	Q02410	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MGAT5	Q09328	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	REST	Q13127	1097 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ACAP2	Q15057	778 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	NEU1	Q99519	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746		B5MCH6	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	RBP3	P10745	1247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ITGAM	P11215	1152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	SCAP	Q12770	1279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	FOXF2	Q12947	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HDAC2-208	ENST00000520746	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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