RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CEP170P1Q96L14 293 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PPP1R36Q96LQ0 422 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 DACH2Q96NX9 599 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 USP11P51784 963 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 GPSM2P81274 684 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 OVGP1Q12889 678 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 RSPH3Q86UC2 560 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 FUKQ8N0W3 1084 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CCT7Q99832 543 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TULP2O00295 520 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CAND2O75155 1236 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PDIA5Q14554 519 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 AURKCQ9UQB9 309 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 NWD1Q149M9 1564 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SOX5P35711 763 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ERVK-9P63128 1117 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 HIF1AQ16665 826 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 MED10Q9BTT4 135 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SNX25Q9H3E2 840 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.42■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 C3P01024 1663 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 F5H423 210 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KLRC4O43908 158 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 S100BP04271 92 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 EMSYQ7Z589 1322 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 MEA1Q16626 185 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC17Q96LX7 622 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 APOL6Q9BWW8 343 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 NACA2Q9H009 215 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PHF2O75151 1096 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PRKG1Q13976 671 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CARD9Q9H257 536 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.41■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KPNA7A9QM74 516 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 OSTNP61366 133 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 EPC2Q52LR7 807 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TYK2P29597 1187 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 LVRNQ6Q4G3 990 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF263O14978 683 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CYP26A1O43174 497 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KRT75O95678 551 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC159P0C7I6 412 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TTC13Q8NBP0 860 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 NSL1Q96IY1 281 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SUN2Q9UH99 717 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF233A6NK53 670 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 F5H6K3 240 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SLC16A4O15374 487 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 GGPS1O95749 300 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 KLRC3Q07444 240 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 C2CD6Q53TS8 623 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.4■□□□□ 0.22
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM270Q6UE05 265 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.4 ms