RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W YPL014WQ02606 381 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRX11Q03079 207 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RSC9Q03124 581 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CNL1Q06333 122 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W OSW1Q08692 278 aa3.58□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARF2P19146 181 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W URE2P23202 354 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PCL1P24867 279 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CDC50P25656 391 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SEC17P32602 292 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PDC2P32896 925 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SNC2P33328 115 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YKL187CP34231 750 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SFK1P35735 353 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RCN1P36054 211 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.57□□□□□ -1.84not detected
YPT53YNL093W RFS1P38234 210 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YBR062CP38239 180 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W IST2P38250 946 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HEM14P40012 539 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W LSM4P40070 187 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FAU1P40099 211 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W GLR1P41921 483 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YFL064CP43540 174 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TIS11P47977 285 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W OST3P48439 350 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TIM13P53299 105 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CPR8P53728 308 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CDC14Q00684 551 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YLR446WQ06204 433 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARR3Q06598 404 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ASA1Q06822 443 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YDL057WQ07379 328 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W UIP4Q08926 304 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPL257WQ08974 193 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPR202WQ08993 238 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FRE8Q12209 686 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SMC4Q12267 1418 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MHT1Q12525 324 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YOR338WQ99326 363 aa3.57□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W LTE1P07866 1435 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COX1P00401 534 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YKR104WP0CE69 306 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CLB2P24869 491 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RPS2P25443 254 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W CPR3P25719 182 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARO7P32178 256 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W APE2P32454 952 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPC1P38298 316 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DOG2P38773 246 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SPL2P38839 148 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W PHM8P40025 321 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SAS2P40963 338 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YFR020WP43600 232 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MSY1P48527 492 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COS10P52924 374 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YIF1P53845 314 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TSA2Q04120 196 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YDR387CQ04162 555 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W TVP18Q04767 167 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YMR317WQ04893 1140 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W COA4Q05809 96 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W THP1Q08231 455 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YPR063CQ12160 140 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ERV2Q12284 196 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.56□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W RAD10P06838 210 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ALG7P07286 448 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W AHC2P25649 128 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SPT14P32363 452 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MKK1P32490 508 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MSN2P33748 704 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W FRE2P36033 711 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRPL3P36516 390 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YGP1P38616 354 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YHR112CP38716 378 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DBP8P38719 431 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ARN1P38731 627 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ECM14P38836 430 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W EGT2P42835 1041 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W SCS3P53012 380 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ERG26P53199 349 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HSK3P69852 69 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YCL001W-AP87012 153 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W ODC1Q03028 310 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W DIG2Q03373 323 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W HSP31Q04432 237 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W YMR320WQ04897 101 aa3.55□□□□□ -1.84
YPT53YNL093W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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