RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	VAV2	P52735	878 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BACE1	P56817	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KRT83	P78385	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	UBXN1	Q04323	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPAG1	Q07617	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	APPBP2	Q92624	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	WNT8B	Q93098	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708		A0A087X0B3	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DNM1L	O00429	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FOXP2	O15409	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB43	O43298	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	NCK2	O43639	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TACC1	O75410	805 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MOCS3	O95396	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MED26	O95402	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ECEL1	O95672	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TGFB1	P01137	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	KRT14	P02533	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CTSB	P07858	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GHR	P10912	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RGS19	P49795	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PPARD	Q03181	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	GABPA	Q06546	454 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SPP2	Q13103	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PAK1	Q13153	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	PAK2	Q13177	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	XRCC4	Q13426	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SFI1-224	ENST00000486708	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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