RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 PIK3CBP42338 1070 aa5.52□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 NRG3P56975 720 aa5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 PPP3CAQ08209 521 aa5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 NFATC3Q12968 1075 aa5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 IL10RAQ13651 578 aa5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 KLC2Q9H0B6 622 aa5.52□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 TICAM2Q86XR7 235 aa5.51□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.51□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.51□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 OR10A5Q9H207 317 aa5.51□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 DPF2Q92785 391 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 MBD6Q96DN6 1003 aa5.5□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 DGKBQ9Y6T7 804 aa5.5□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 ARIH2O95376 493 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
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VPS13A-211ENST00000484581 CCT5P48643 541 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 CDC42EP1Q00587 391 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 NOGQ13253 232 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 BIRC3Q13489 604 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 TRIM14Q14142 442 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 FGL2Q14314 439 aa5.49□□□□□ -1.53
VPS13A-211ENST00000484581 STILQ15468 1287 aa5.49□□□□□ -1.53
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