RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USH1CQ9Y6N9 552 aa17.58■□□□□ 0.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APRTP07741 180 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPDYE6P0CI01 402 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCP1P13796 627 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROR1Q01973 937 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIF1AQ16665 826 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC26Q8NHZ8 85 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCT8L2Q96SF2 557 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAGPAQ9UK23 515 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANXA13P27216 316 aa17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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