RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CSRP2Q16527 193 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 TKFCQ3LXA3 575 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf27AQ580R0 203 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 LCE2CQ5TA81 110 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 PJA1Q8NG27 643 aa4.75□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CA14Q9ULX7 337 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.75□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ITPR3Q14573 2671 aa4.75□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 NUP205Q92621 2012 aa4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 DGKIO75912 1065 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNK5O95279 499 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 NSMFQ6X4W1 530 aa4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 SERINC5Q86VE9 423 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 COPS5Q92905 334 aa4.74□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 USP44Q9H0E7 712 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ST7Q9NRC1 585 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 FEM1BQ9UK73 627 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KALRNO60229 2985 aa4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 PI4KAP42356 2102 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 B2RBV5 119 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 F5H6K3 240 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
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ECHDC1-211ENST00000460558 IDH1O75874 414 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFB10O96000 172 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 WEE2P0C1S8 567 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 SLFN14P0C7P3 912 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 SRFP11831 508 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ALAS1P13196 640 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 GLULP15104 373 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEA9P43362 315 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 NLRP12P59046 1061 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVFC1P60507 584 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 ID3Q02535 119 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 KLRC3Q07444 240 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 TFCP2Q12800 502 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 NCAPHQ15003 741 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 RALBP1Q15311 655 aa4.73□□□□□ -1.65
ECHDC1-211ENST00000460558 LPAL2Q16609 132 aa4.73□□□□□ -1.65
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