RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PGRP06401 933 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTGS1P23219 599 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COX20Q5RI15 118 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 METRNLQ641Q3 311 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRTC3Q6UUV7 619 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RTN4RL2Q86UN3 420 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THNSL2Q86YJ6 484 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ABTB2Q8N961 1025 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL17RCQ8NAC3 791 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARL8AQ96BM9 186 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RTP4Q96DX8 246 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHF21BQ96EK2 531 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLPPR2Q96GM1 343 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NLRP4Q96MN2 994 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HINFPQ9BQA5 517 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUBB6Q9BUF5 446 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL25Q9H293 177 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCTD5Q9NXV2 234 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAN1B1Q9UKM7 699 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDC14AQ9UNH5 594 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COG5Q9UP83 839 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APBB1O00213 710 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SYF2O95926 243 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV1-17P01599 117 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV4-1P06312 121 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GLRBP48167 497 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF84P51523 738 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRISP1P54107 249 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DRG2P55039 364 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NCOA4Q13772 614 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INPP5AQ14642 412 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IQCCQ4KMZ1 466 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GAGE13Q4V321 117 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MROH9Q5TGP6 573 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA0319Q5VV43 1072 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA0895LQ68EN5 471 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LLGL2Q6P1M3 1020 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MMP21Q8N119 569 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CADM4Q8NFZ8 388 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM129BQ96TA1 746 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SELENOOQ9BVL4 669 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC12A9Q9BXP2 914 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF700Q9H0M5 742 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF696Q9H7X3 374 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL23AQ9NPF7 189 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HEY2Q9UBP5 337 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SERGEFQ9UGK8 458 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF229Q9UJW7 825 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WASF3Q9UPY6 502 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NOX1Q9Y5S8 564 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBE2QL1A1L167 161 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDUFAF8A1L188 74 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNFRSF21O75509 655 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT33AO76009 404 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WEE2P0C1S8 567 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RARBP10826 455 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ACADSP16219 412 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALDH1B1P30837 517 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDK8P49336 464 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBM25P49756 843 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADCY7P51828 1080 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UCNP55089 124 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEC13P55735 322 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP12-1P59990 96 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LYZP61626 148 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR72Q3MJ13 1102 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C9orf57Q5W0N0 161 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEP85Q6P2H3 762 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP-1.13□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms