RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeastyeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDR2YOL052C-A SED4P25365 1065 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A CLG1P35190 452 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A TAT1P38085 619 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A CAT5P41735 233 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MRPS16Q02608 121 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A YPR196WQ06595 470 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A ISA2Q12425 185 aa9.56□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A COX5BP00425 151 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A CDC34P14682 295 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A PET18P25362 215 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A DBF20P32328 564 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data9.55□□□□□ -0.88not detected
DDR2YOL052C-A PPG1P32838 368 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A GPI14P47088 403 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A NIT3P49954 291 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A YNR040WP53736 256 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A HHT1P61830 136 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A YAP6Q03935 383 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A HEM25Q07534 307 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A SRL2Q12020 392 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MCT1Q12283 360 aa9.55□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A CDC23P16522 626 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A PUP1P25043 261 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MSS1P32559 526 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MRPL3P36516 390 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A YHR122WP38829 231 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A SOL3P38858 249 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A BUD8P41698 603 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A ELA1P53861 379 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MRP51Q02950 344 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A UTP15Q04305 513 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A RAF1Q06891 181 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A ENV7Q12003 364 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A IZH2Q12442 317 aa9.54□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A MES1P00958 751 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A GCD1P09032 578 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A HXT2P23585 541 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A UMP1P38293 148 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A AVT7P40501 490 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A CTK2P46962 323 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A FMP48P53233 369 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A TNA1P53322 534 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A THI72Q08579 599 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A YLR125WQ12138 136 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A ODC2Q99297 307 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A FSH3Q99369 266 aa9.53□□□□□ -0.88
DDR2YOL052C-A TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data9.52□□□□□ -0.89not detected
DDR2YOL052C-A PHO2P07269 559 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A NHP6BP11633 99 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A ACH1P32316 526 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A AFG1P32317 509 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A MRT4P33201 236 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A PPZ2P33329 710 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YMR262WP38430 313 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YIL060WP40519 144 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A UBX6P47049 396 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YGL260WP53056 76 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A MTL1P53214 551 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YNR048WP53740 393 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A GIM3P53900 129 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RNH201P53942 307 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A BUD25P85052 153 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A MRPL13Q02204 264 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A HNT1Q04344 158 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YLR352WQ06479 807 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YPL272CQ08984 517 aa9.52□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RPL3P14126 387 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A PCL1P24867 279 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RNP1P32385 249 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A STS1P38637 319 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A MTC6P38849 526 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A XBP1P40489 647 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YJL016WP47072 561 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A BXI1P48558 297 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A DIE2P50076 525 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YGL159WP53110 370 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A GPG1P53130 126 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A TY1A-MR1Q04215 440 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YDL218WQ07629 317 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RSC58Q07979 502 aa9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A USB1Q12208 290 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A SGA1P08019 549 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RPL30P14120 105 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A URA6P15700 204 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RNA14P25298 677 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A ATG22P25568 528 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A IDP2P41939 412 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A CIN2P46670 268 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YGR042WP53227 271 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RCE1Q03530 315 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YLR031WQ07978 186 aa9.5□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A RAD52P06778 471 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A DSF1P0CX08 502 aa9.49□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A YNR073CP0CX09 502 aa9.49□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A MCM1P11746 286 aa9.49□□□□□ -0.89
DDR2YOL052C-A SAR1P20606 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 77.1 ms