RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 CEP70Q8NHQ1 597 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 ALG3Q92685 438 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 DIP2AQ14689 1571 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 YARSP54577 528 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf146Q5VVC0 180 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM154Q6P9G4 183 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA24Q86W54 205 aa13.15□□□□□ -0.3
TRIOBP-211ENST00000492485 ERICH1Q86X53 443 aa13.15□□□□□ -0.3
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TRIOBP-211ENST00000492485 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.15□□□□□ -0.3
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TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM143Q96AN5 459 aa13.15□□□□□ -0.3
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TRIOBP-211ENST00000492485 RCAN1P53805 252 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 GIT2Q14161 759 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP2R5EQ16537 467 aa13.14□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.14□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM86B1E9PN63 330 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP6V1G2O95670 118 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 FOSP01100 380 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ARP10275 920 aa13.14□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 PDIA5Q14554 519 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SH2D4BQ5SQS7 431 aa13.14□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.14□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 ETS1P14921 441 aa13.13□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 KCNV1Q6PIU1 500 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.13□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 RMDN3Q96TC7 470 aa13.13□□□□□ -0.31
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TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINB4P48594 390 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 FRMD5Q7Z6J6 570 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.13□□□□□ -0.31
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF384Q8TF68 577 aa13.13□□□□□ -0.31
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