RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 JAK3P52333 1124 aa28.25■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 PADI6Q6TGC4 694 aa28.25■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 IKZF4Q9H2S9 585 aa28.25■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 ELP3Q9H9T3 547 aa28.25■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa28.25■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.24■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.24■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 RTN2O75298 545 aa28.24■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.24■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 KSR1Q8IVT5 923 aa28.24■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 TLCD1Q96CP7 247 aa28.24■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 ALG6Q9Y672 507 aa28.24■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 PLS3P13797 630 aa28.23■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 ABCB4P21439 1286 aa28.23■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 C4orf19Q8IY42 314 aa28.23■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 MYH11P35749 1972 aa28.23■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 C5orf60A6NFR6 353 aa28.22■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 HUNKP57058 714 aa28.22■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 GTF2BQ00403 316 aa28.22■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.22■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 SKIDA1Q1XH10 827 aa28.22■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 WDR81Q562E7 1941 aa28.22■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 PSMC5P62195 406 aa28.2■■■□□ 2.11
TPI1-201ENST00000229270 CYP1B1Q16678 543 aa28.2■■■□□ 2.11
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TPI1-201ENST00000229270 E7EVH7 732 aa28.19■■■□□ 2.1
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TPI1-201ENST00000229270 PTGIRP43119 386 aa28.19■■■□□ 2.1
TPI1-201ENST00000229270 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TPI1-201ENST00000229270 FAM71AQ8IYT1 594 aa28.19■■■□□ 2.1
TPI1-201ENST00000229270 ALG3Q92685 438 aa28.19■■■□□ 2.1
TPI1-201ENST00000229270 PGM2Q96G03 612 aa28.19■■■□□ 2.1
TPI1-201ENST00000229270 DPH5Q9H2P9 285 aa28.19■■■□□ 2.1
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