RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-208ENST00000618318 PLXNB2O15031 1838 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.56□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 HTTP42858 3142 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GPR25O00155 361 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SEPT4O43236 478 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 AKR1B10O60218 316 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.049e-6■■■■□ 23.7
RPRD1B-208ENST00000618318 F2P00734 622 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SERPING1P05155 500 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF286BP0CG31 522 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 RARBP10826 455 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 UCHL3P15374 230 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 FERP16591 822 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ADSSP30520 456 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PSEN2P49810 448 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KLK7P49862 253 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 MXI1P50539 228 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CYP24A1Q07973 514 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 MFSD10Q14728 455 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PSMD6Q15008 389 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ASIC2Q16515 512 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CCL14Q16627 93 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM139Q8IV31 216 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KIF18AQ8NI77 898 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NLRP4Q96MN2 994 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SCLT1Q96NL6 688 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 STK33Q9BYT3 514 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 FZD8Q9H461 694 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GCNT4Q9P109 453 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 USP20Q9Y2K6 914 aa8.55□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 MYH11P35749 1972 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 A0A0B4J269 797 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 LRRC53A6NM62 1247 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 OGTO15294 1046 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KIF5CO60282 957 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GFPT2O94808 682 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NDUFA10O95299 355 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 IGHA2P01877 340 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TNNI1P19237 187 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SLC9A1P19634 815 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CLCN3P51790 818 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GJA9P57773 515 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 WDR44Q5JSH3 913 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 GNASQ5JWF2 1037 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 KIAA1328Q86T90 577 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 RSPH3Q86UC2 560 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 C7orf31Q8N865 590 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 RAET1EQ8TD07 263 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 NLRP7Q8WX94 980 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 SAAL1Q96ER3 474 aa8.54□□□□□ -1.04
RPRD1B-208ENST00000618318 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.54□□□□□ -1.04
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