RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 PPP1R2P41236 205 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM189BP81408 668 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 YME1L1Q96TA2 773 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PARP2Q9UGN5 583 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTC3P53804 2025 aa14.75□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TLL1O43897 1013 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PROZP22891 400 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 OSTNP61366 133 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MCL1Q07820 350 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MORC3Q14149 939 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 NFKBIBQ15653 356 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 KYAT1Q16773 422 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 LPPQ93052 612 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRO3102Q9H379 93 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HES2Q9Y543 173 aa14.74□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A0B4J269 797 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TISP43B9A030 160 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 OGTO15294 1046 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GJB5O95377 273 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 FGFR1P11362 822 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GARTP22102 1010 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GRM5P41594 1212 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 URGCPQ8TCY9 931 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ACAP3Q96P50 834 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TSG101Q99816 390 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RSAD1Q9HA92 442 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNTG2Q9NY99 539 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MSRAQ9UJ68 235 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 INSL6Q9Y581 213 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PDXKO00764 312 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ABLIM1O14639 778 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSMA7O14818 248 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLIC2O15247 247 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RECQL4O94761 1208 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 AKAP5P24588 427 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOXD13P35453 343 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRCPP42785 496 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP120Q8N960 986 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 HELQQ8TDG4 1101 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAD9AQ99638 391 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPRSQ13332 1948 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TGFB1I1O43294 461 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 DGKIO75912 1065 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLTAP09496 248 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYP2J2P51589 502 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RABGGTBP53611 331 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAB30Q15771 203 aa14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEZ6Q53EL9 994 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.6 ms