RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 SNTG2Q9NY99 539 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa20.45■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 VCANP13611 3396 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MYMKA6NI61 221 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 INPPL1O15357 1258 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 GALTP07902 379 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PPM1AP35813 382 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC11A1P49279 550 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVFC1P60507 584 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TFF2Q03403 129 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE3AQ05086 875 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 STRN3Q13033 797 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 THEGQ9P2T0 379 aa20.44■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB33Q86T24 672 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX12PQ92771 950 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 CDT1Q9H211 546 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TLR9Q9NR96 1032 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 GDAQ9Y2T3 454 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.43■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO7AQ13402 2215 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 K7ENM7 598 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAK2O60296 914 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 RECQL4O94761 1208 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT17Q04695 432 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 E2F4Q16254 413 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 STAMQ92783 540 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-CQ95604 372 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 FIZ1Q96SL8 496 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 LZTS1Q9Y250 596 aa20.42■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ABLIM1O14639 778 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PROZP22891 400 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 HYAL1Q12794 435 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP120Q8N960 986 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 DHX58Q96C10 678 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM169Q96HH4 297 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 IGSF21Q96ID5 467 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TCF25Q9BQ70 676 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TCHPQ9BT92 498 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 IGFLR1Q9H665 355 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 COG5Q9UP83 839 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH11P35749 1972 aa20.41■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 H0YCG3 227 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 NRP1O14786 923 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 FSCN2O14926 492 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ALDH2P05091 517 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 OSTNP61366 133 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT85P78386 507 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 DSC1Q08554 894 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 RESP18Q5W5W9 173 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 SFR1Q86XK3 245 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA32Q96LK8 384 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 TBX20Q9UMR3 447 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.4■□□□□ 0.86
GCSHP2-201ENST00000560971 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 F8W810 466 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGESO14684 152 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 MCF2P10911 925 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 OR1G1P47890 313 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 RABGGTAQ92696 567 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNN1Q92952 543 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 BICD1Q96G01 975 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 ASB2Q96Q27 587 aa20.39■□□□□ 0.85
GCSHP2-201ENST00000560971 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms