RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504398.1

AC008825.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC008825.1, Length 452 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008825.1-201ENST00000504398 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 RAD9AQ99638 391 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CDT1Q9H211 546 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 IPPQ9Y573 584 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 INSL6Q9Y581 213 aa20.3■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 PDXKO00764 312 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 NPTXRO95502 500 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ITGA4P13612 1032 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 HOXD13P35453 343 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 GRM5P41594 1212 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 MYBPC2Q14324 1141 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 USP20Q9Y2K6 914 aa20.29■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 OGTO15294 1046 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 DGKIO75912 1065 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 GDAQ9Y2T3 454 aa20.28■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 INPPL1O15357 1258 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TGFB1I1O43294 461 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 UPP2O95045 317 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CLTAP09496 248 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 NFIL3Q16649 462 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ABI1Q8IZP0 508 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ADSSL1Q8N142 457 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 MLKLQ8NB16 471 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
AC008825.1-201ENST00000504398 CARNS1A5YM72 827 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 PSMA7O14818 248 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 ADSSP30520 456 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 PRCPP42785 496 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RAB30Q15771 203 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 CENPPQ6IPU0 288 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 ZBTB33Q86T24 672 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 ACAP3Q96P50 834 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RSAD1Q9HA92 442 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.26■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 TLL1O43897 1013 aa20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 NFKBIBQ15653 356 aa20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 CD302Q8IX05 232 aa20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RNF169Q8NCN4 708 aa20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 YME1L1Q96TA2 773 aa20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 BIN1O00499 593 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 EXTL3O43909 919 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM189A1O60320 539 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 OFD1O75665 1012 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 BMP6P22004 513 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 URGCPQ8TCY9 931 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RNF39Q9H2S5 420 aa20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
AC008825.1-201ENST00000504398 RNF19AQ9NV58 838 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms