RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC10P48553 1259 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PADI6Q6TGC4 694 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KREMEN2Q8NCW0 462 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASIC4Q96FT7 647 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS6KC1Q96S38 1066 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF2CQ99661 725 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP2Q9UGN5 583 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIEZO1Q92508 2521 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP11B2P19099 503 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLUD2P49448 558 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHLH1Q02575 133 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR149Q86SP6 731 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FZD8Q9H461 694 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK14Q9P0G3 267 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORCS3Q9UPU3 1222 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFEMP2O95967 443 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADH1AP07327 375 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUTP22033 750 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM187BQ17R55 369 aa28.96■■■□□ 2.23
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSTCDQ8NEC7 633 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USTQ9Y2C2 406 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8W810 466 aa28.95■■■□□ 2.22
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIK3Q13003 919 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR3Q13615 1198 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM132AQ24JP5 1023 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BSNDQ8WZ55 320 aa28.95■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 N4BP3O15049 544 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX28O15482 410 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAMPTP43490 491 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBR1Q14596 966 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPK6Q16659 721 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RXFP1Q9HBX9 757 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSG1Q02413 1049 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R5AQ15172 486 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf34Q49A92 452 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEPTORQ8TB45 409 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST7Q9NS84 486 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIMD1Q9UGP4 676 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPP7Q9UHL4 492 aa28.93■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND4AQ7Z401 1863 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKCBP05771 671 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECM1Q16610 540 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IER5LQ5T953 404 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUT10Q6P4F1 479 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC149Q6ZUS6 474 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRRX2Q99811 253 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACKR2O00590 384 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRD1O95696 1058 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLUD1P00367 558 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASGR2P07307 311 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIG1P18858 919 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDIA5Q14554 519 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP41Q3LFD5 358 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RABGGTAQ92696 567 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT74Q96LB3 600 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADPGKQ9BRR6 497 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC113Q9H0I3 377 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHMT2Q9H2M3 363 aa28.91■■■□□ 2.22
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK24Q9Y6E0 443 aa28.91■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO10Q9HD67 2058 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGDRQ13258 359 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTOP3Q7RTS5 596 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS33Q8NF86 280 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B3GALT6Q96L58 329 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB34Q9BZG1 259 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNTG2Q9NY99 539 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLXNA3P51805 1871 aa28.89■■■□□ 2.22
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