RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314742.12

LINS1-201, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LINS1, Length 4,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-201ENST00000314742 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 AURKCQ9UQB9 309 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ST18O60284 1047 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MAN1A2O60476 641 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PGM3O95394 542 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CYP17A1P05093 508 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ENPP1P22413 925 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 FCGRTP55899 365 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MBTPS1Q14703 1052 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PLCL1Q15111 1095 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ECM1Q16610 540 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TUSC1Q2TAM9 212 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SMIM5Q71RC9 77 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 RNF180Q86T96 592 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CCDC63Q8NA47 563 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 IFT22Q9H7X7 185 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SNX6Q9UNH7 406 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 H0YCG3 227 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PRG2P13727 222 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 RXRAP19793 462 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 WEE1P30291 646 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TUBA3CQ13748 450 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 KCTD6Q8NC69 237 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 HMX3A6NHT5 357 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 KCNQ2O43526 872 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 DDX58O95786 925 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 GHRP10912 638 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CBX3Q13185 183 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 RCN2Q14257 317 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 STK38Q15208 465 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SURF1Q15526 300 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 FBXO30Q8TB52 745 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NRBF2Q96F24 287 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SPEGQ15772 3267 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MGEA5O60502 916 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CKBP12277 381 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 RXRGP48443 463 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 GJA9P57773 515 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PTK2Q05397 1052 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NECTIN1Q15223 517 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 FAM209AQ5JX71 171 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 DACT2Q5SW24 774 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 LRRC49Q8IUZ0 686 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 DDI1Q8WTU0 396 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 SERINC2Q96SA4 455 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 A0A0D9SFI3 127 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 M0QX08 132 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 NEMP1O14524 444 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 GPR39O43194 453 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PROM1O43490 865 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 MICAL2O94851 1124 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 PF4P02776 101 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 CDH3P22223 829 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 ASMTP46597 345 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 GMFBP60983 142 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-201ENST00000314742 USP46P62068 366 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms